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工商注册信息已核实!参考报价: | 面议 | 型号: | Patharray™机制研究服务——生物信息分析 |
品牌: | 吉凯基因 | 产地: | 上海 |
关注度: | 25 | 信息完整度: | |
样本: | 典型用户: | 暂无 |
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Patharray™机制研究服务——生物信息分析
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芯片综合产品分析流程
数据分析样例
1. 芯片数据QC
1.1 Signal Histogram
芯片的信号值分布图。每条信号分布曲线的重合度越好表示芯片实验的可靠性越高。
1.2 Relative Signal Box Plot
芯片Normalization后的箱型图,红线是baseline。此图表示了每张芯片数据在进行permutation后的百分位数分布,它们的分布越接近,数据的重复性就越高。
1.3 Pearson's Correlation (signal)
芯片的相关系数图,表示所有芯片两两之间的相关程度,本图使用皮尔森相关系数,当系数等于1.0时未完全正相关,相关系数越接近1.0,其相关性越高。
1.4 PCA
PCA (Principal Component Analysis), 主成分分析。用来表示每张芯片在组内组间的相似和差异度。
2. 芯片数据分析
2.1 有显著差异表现的基因数目
根据实验设计要求,将差异基因的比较结果以下表呈现,基因表现有显著差异的筛选标准为必须符合丨FC丨要大于2,并且P value值要小于0.05,详细基因表达分析见“数据分析报告”
项目比较组上调基因数下调基因数1C16_+ vs C16_-33858备注:
2.2 火山图
2.3 散点图
2.4 聚类图
3. Pathway和GO分析
根据筛选出的差异基因,进行Pathway分析和Gene Ontology分析(即GO分析)。
根据生物学功能的不同,将差异基因进行Pathway Analysis,计算包含多少差异基因,并列式基因名称。
Pathway分析
GO分析
4. 深入分析
根据初步分析结果,挑选感兴趣的pathway/gene进行深入分析。
5.下游基因验证
Patharray™机制研究服务——生物信息分析信息由上海吉凯基因医学科技股份有限公司为您提供,如您想了解更多关于Patharray™机制研究服务——生物信息分析报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途