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nrStar™ tRF&tiRNA PCR芯片技术服务

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品牌: 暂无 产地: 暂无
关注度: 28 信息完整度:
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作为一种新型的tRNA来源的非编码小RNAtRF& tiRNA由精确调控的生物发生过程所产生,参与行使多种生物学功能: 作为microRNA参与RNA干扰;调节靶向mRNA的稳定性;在细胞应激条件下促进应激颗粒(SG)的组装;调控细胞凋亡;作为表观遗传因子在世代间传递。tRFs& tiRNA的组成和含量高度依赖于细胞类型,并且与多种病理状态密切相关。它们在生物体液中广泛存在,含量远超microRNA,使之有望成为极佳的分子标志物。
      Arraystar
公司zei新发布的 nrStar™ Human tRF & tiRNA PCR Array包含了185类来自权威数据库收录和zei新文献报道的tRFtiRNA,方便客户对tRF & tiRNA进行简单快捷地表达谱分析。

nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR芯片服务列表

服务 

芯片

规格

描述

NEW  nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array Service

NEW nrStar™ Human tRF&tiRNA PCR Array

384-well (2*192) plate

包含了185类来自权威数据库收录和zei新文献报道的tRFtiRNA

芯片特点
● 前沿近年来tRF & tiRNA研究呈井喷式的增长
● 
专注专注于出现频次高、生理病理关联性强的tRF&tiRNA类群
● 
严谨每一对qPCR引物都经过精心地优化和严格地测试
● 
便捷随取随用,极致便捷;标准qPCR板型直接测样,无需预扩增

康成tRF&tiRNA PCR芯片服务实验流程
1. RNA抽提与质量检测
    进行RNA常规抽提,使用NanoDrop ND-1000检测RNA浓度和纯度,使用琼脂糖凝胶电泳检测RNA纯度和完整性。详细的样品QC结果见Arraystar服务报告。
2. 双端接头连接与cDNA合成
    每样本取1.5 μg RNA,使用rtStar™ First-Strand cDNA Synthesis Kit (3’ and 5’ adaptor) (Cat# AS-FS-003, Arraystar) 试剂盒进行接头连接和反转,合成cDNA第一链。详细步骤参照Arraystar产品操作手册。
3. Real-time PCR扩增
    cDNA Arraystar SYBR Green qPCR Master Mix (Cat# AS-MR-005-5, Arraystar)混合,加入至384孔板中,在ABI 7900 PCR仪上进行Real-time PCR扩增。
4. 熔解曲线分析与原始数据导出
    PCR扩增完成后,进行熔解曲线分析,使用PCR仪自带软件导出原始数据。出具Raw Data文件夹,包含原始Ct值、PCR扩增曲线图和熔解曲线图。

康成tRF&tiRNA PCR芯片服务数据分析流程
1.  PCR芯片数据质控
    质控参数:Ct(Blank)>35; Ct(GDC)>35; Ct(RNA Spike-in)<25; Ct (PPC) <25. 符合上述条件的样本进入下一步分析。数据QC结果见Arraystar服务报告。

2.   数据校正与△Ct值计算
      板间校正:使用Ct(PPC)对不同PCR板进行板间校正。
      内参校正与△Ct值计算:挑选zei优内参,使用内参均值计算△Ct值。

3.    差异倍数计算 (2^(-△△Ct))
       使用 △△Ct 方法计算不同样品组之间的表达差异倍数。
4. P值计算
    对样本组进行t检验,计算P值。
5. 其他常规数据分析
    散点图分析;火山图分析;TOP20表达上调和下调tRF&tiRNA柱形图分析
6. 提供服务报告与数据分析结果
    a. Arraystar服务报告(包括RNA样本QCqPCR数据QC和详细实验数据分析步骤)
    b. Excel
芯片结果汇总表(包括tRF&tiRNA列表,数据分析结果和各类图表)
    c. Raw Data
文件夹 (包含原始数据、扩增曲线图和熔解曲线图)

康成tRF&tiRNA PCR芯片服务部分数据分析结果展示
1. 差异表达tRF & tiRNA列表(默认筛选参数:差异倍数>2P<0.05,客户可指定筛选参数值)
 

2. 散点图 (黑色斜线代表差异倍数为1,红色斜线代表差异倍数为2)
       
                      


3. 
火山图(黑色垂线代表差异倍数为1;粉色垂线代表上调或下调倍数为2;蓝色水平线代表P值为0.05

                     
4. TOP20表达上调tRF & tiRNA柱状图
 
5. TOP20表达下调tRF & tiRNA柱状图

 

上海康成生物工程有限公司 

地址:上海市漕河泾高新技术开发区虹漕路421号63号楼2楼 
免费热线:400-886-5058 ; 800-820-5058(座机)
电话:021-64451989         传真:021-64452021

网址:www.kangchen.com.cn 

nrStar™ tRF&tiRNA PCR芯片技术服务信息由上海康成生物工程有限公司为您提供,如您想了解更多关于nrStar™ tRF&tiRNA PCR芯片技术服务报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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