您好,欢迎您查看分析测试百科网,请问有什么帮助您的?

稍后再说 立即咨询
咨询列表
上海伯豪生物技术有限公司
X
头像

客服中心

如果企业客服不在线,也可拨打400电话联系。或者发布求购信息

400-6699-1171000
发布求购 实验百科采购-随时微信沟通
扫码关注
实验采购百科

上海伯豪生物技术有限公司

400-6699-117转1000
热门搜索:
分析测试百科网 > 伯豪生物 >  Illumina Omni家族芯片服务 > Illumina Omni家族芯片服务

Illumina Omni家族芯片服务

参考报价: 面议 型号: Illumina Omni家族芯片服务
品牌: 伯豪生物 产地: 上海
关注度: 58 信息完整度:
样本: 典型用户: 暂无
咨询留言 在线咨询

400-6699-1171000

Omni芯片家族自2009年上市以来,已经提供了一系列灵活的芯片,它们带来了精选自国际HapMap计划和千人基因组计划的常见和稀有变异。有了Omni芯片家族,研究人员能够立即开始新一代GWAS。


Omni家族芯片产品信息

注:自定义位点是在芯片SNP位点基础上,可自定义添加最大位点数,N/A表示不能添加。

1. Human Omni ZhongHua-8 BeadChip芯片服务 (推荐)—特别覆盖中国人特有的常见和稀有变异

1)人类种群特异的全基因组芯片,经过优化的标签SNP内容来自HapMap所有三个阶段以及千人基因组计划(1kGP),可用于在中国人种群中探索全新的疾病和性状关联。
2)特别覆盖中国人81%的常见变异(MAF> 5%)和60%的稀有变异(MAF > 2.5%),适合全基因组关联研究(GWAS)。
3)采用Illumina专利的BeadArrayTM技术,可提供非常高的数据质量,平均检 出率> 99%,重复率> 99.9%。

来源:illumina官网

2.HumanOmni5-Quad芯片服务

1)4个样品的Omni5芯片特有超过430万个标记物/样品。
2)特有来自千人基因组计划的新颖、常见和稀有变异。除了提供人类变异(MAF低至1%)的密集覆盖,覆盖了基因组中与疾病关联的高价值区域,包括基因区域、MHC区域和非同义SNP。
3)特有来自千人基因组计划的近5000个插入缺失和多碱基替换标记物,能帮助研究人员阐明结构变异如何影响性状和疾病。
4)可自定义的 500K位点让研究变得更具灵活性,可以方便更高密度靶定基因组的特定区域。

简单的实验过程:

来源:illumina官网

更多的发现内容:

您需要给我们提供:

样品类型:组织、细胞、基因组DNA( > 3微克)

样品要求:
1) 样品纯度:OD 260/280值应在1.7~2.0 之间;RNA 应该去除干净;不得有其它个体或其它物种的DNA污染。
2) 样品浓度:浓度不低于55ng/μl;
3) 样品总量:每个样品总量不少于5μg 。
4) 样品溶剂:溶解在TE中。
5) 样品运输: DNA低温运输(-20℃);在运输过程中请用parafilm将管口密封好,以防出现污染。

我们能给您提供:

数据分析结果展示(示意图) :

Manhattan plot:可以用来观测各个染色体中显著差异SNP探针的数据分布。基因组坐标沿X-轴显示,显示在Y-轴为每个单核苷酸多态性的关联P-值的负对数。

连锁不平衡(linkage disequilibrium)是指基因组中不同基因座间存在的非随机关联,即不同基因座的非等位基因间的非随机组合。LD Plot表示该基因所有snp的的连锁情况,各个方块的颜色由浅至深(白—红),表示连锁程度由低到高,深红色表示完全连锁。

LOD Plot (log odds score)是根据遗传标志与致病基因的连锁,和在家系中的重组值,即两者之间的遗传距离,得出两者连锁的似然性比例。LOD值为0,意味着连锁假设与不连锁假设的可能性相等;LOD值为正值,有利于连锁;LOD值为负值,表示有一定重组率的连锁。显著的域值是﹢3和﹢2。LOD﹦﹢3时,连锁的概率为95%。

单倍型又称单体型,是tagSNP的call在染色单体上的线性排列,单倍型分析的目的是看是否所有患病个体都继承了同样的单体型。在下图中,患病个体画框的里面单体型是一样的。

SBC应用案例

应用案例一:GWAS研究发现东亚人群高血压易感基因

Meta-analysis of genome-wide association studies identifies common variants associated with blood pressure variation in east Asians. Nat Genet. 2011 Jun;43(6):531-8. Epub 2011 May 15.

来自日本全球健康与医学研究中心,国家人类基因组南方研究中心,上海交通大学,清华大学,美国杜兰大学等6个国家研究人员组成的研究小组通过基因组分析,发现了多个东亚地区人群高血压易感基因,研究证明东亚地区人群基因组存在特异性,这对于防治预防高血压等相关的疾病具有重要意义。这一研究成果公布在2011年6月的Nature Genetics杂志上。

应用案例二:Illunima SNP芯片发现汉族人群红斑狼疮易感基因
Genome-wide association study in a Chinese Han population identifies nine new susceptibility loci for systemic lupus erythematosus. Nature Genetics. 2009, 41(11):1234-7.

安徽医科大学一附属医院张学军教授领衔的研究团队通过对12000多例中国汉族红斑狼疮患者和健康对照样本进行研究,发现了5个与汉族人群发病密切相关的易感基因ETS1、 IKZF1、 RASGRP3、 SLC15A4和TNIP1,并确定了4个新的易感位点;研究同时验证了在欧洲人中发现的7个易感基因在汉族人中同样存在。

应用案例三:Illunima SNP芯片发现银屑病发病相关基因LCE
Psoriasis genome-wide association study identifies susceptibility variants within LCE gene cluster at 1q21. Nat Genet. 2009. 41(2):205-10.

安徽医科大学,国家人类基因组南方研究中心,生物芯片上海国家工程中心等处的研究人员利用Illumina BeadArray全基因组关联分析技术平台采用了人类全基因组关联分析研究(GWAS)方法,通过15000例中国汉族和维吾尔族银屑病和健康对照人群大样本量研究,发现了与银屑病发病机制密切相关的LCE基因变异。LCE基因编码表皮终末分化角质外膜蛋白,其基因变异可以增加患病风险。

应用案例四: GWAS发现格雷夫斯氏病两个新易感基因位点
A genome-wide association study identifies two new risk loci for Graves' disease . Nature Genetics. 2011, 43(9):897-901.

上海交通大学医学院附属瑞金医院,国家人类基因组南方研究中心,徐州医学院附属医院等十几家医疗机构的研究人员对3052名受试者进行了全基因组关联分析,发现了两个新的基因位点,一个是位于染色体上的6q27区域内的RNASET2,另一个是4p14区域内的GDCG4p14基因。这项新研究不仅找到了与甲亢发病相关的两处新的染色体变异区域,揭示了致病基因差异是导致甲亢药物治疗效果因人而异的原因,初步解开了甲亢 发病机制的谜团。并为甲亢治疗方法的窜则和预后的评估提供了重要的生物标志。

Illumina Omni家族芯片服务信息由上海伯豪生物技术有限公司为您提供,如您想了解更多关于Illumina Omni家族芯片服务报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

Illumina Omni家族芯片服务 - 产品推荐

移动版: 资讯 直播 仪器谱

Copyright ©2007-2023 ANTPEDIA, All Rights Reserved

京ICP备07018254号 京公网安备1101085018 电信与信息服务业务经营许可证:京ICP证110310号