SNP芯片服务

人类基因组由30亿个核苷酸组成，它们携带着人类的遗传信息并决定人体的生理特征。人类基因组序列的0.1%—0.2%在人种、人群和个体之间存在DNA序列的差异，即单核苷酸多态性（SNP，single nucleotide polymorphism）。许多的这些单核苷酸多态性可引起不同的遗传性状，即遗传的多态性（polymorphism），如ABO血型位点标记，白细胞HLA位点标记和个体药物代谢差异等。了解这些DNA序列的差异和单核苷酸多态性以及这些差异所表现的意义将给疾病的预测、诊断、预后和预防带来革命性的变化。

2005年4月29日，Affymetrix Inc.总裁苏珊西格尔女士率领代表团出席Affymetrix生物芯片上海服务中心的开张和揭牌仪式，标志着SBC成为国内第一个通过Affymetrix认证的，有资质的技术服务商。SBC为客户提供稳定而优质的Affymetrix SNP分析检测服务，为客户提供芯片杂交、洗涤、扫描和数据分析等服务。同时，我们还利用SBC与南方基因中心的合资子公司南方基因科技有限公司引进的Illumina微珠基因分型分析系统为广大科研工作者提供SNP芯片技术服务。

近年来，SBC利用平台优势，为广大客户完成了多个项目，其中包括运用Affymetrix SNP 6.0芯片完成对狼人综合症疾病的遗传基础研究、illumina芯片对银屑病易感基因的筛选等（详情请见参考文献）。

Affymetrix SNP芯片服务

新品推荐：Affymetrix DMET Plus Premier Pack

芯片介绍：人类基因组上的差异（SNP、插入、缺失、复制等）会导致不同个体对同一药物产生不同的反应。针对这种情况，Affymetrix推出了DMET（Drug-Metabolizing Enzymes and Transporters）Plus完整解决方案，该解决方案包含芯片、试剂和分析软件，是目前业界同类产品中信息量最大、最具成本效益的产品。它能检测225个基因中与药物代谢和转运有关的1936个分子标记。这些分子标记已经在不同种族（Caucasian, African and Asian）、至少1200个个体中验证，被证明是确实有效的。通过检测不同个体这些分子标记的差异，科学家们可以发现药物发挥不同作用的遗传机制，从而决定药物的使用对象、剂量，发现药物发挥作用的机制等。

芯片内容：225个基因中与药物代谢相关的1936个分子标记；所有经FDA验证的基因中的分子标记；90%以上PharmaADME组织所确认的ADME分子标记。

芯片推荐：Genome-Wide Human SNP Array 6.0

芯片介绍：Affymetrix Genome-Wide Human SNP 6.0芯片产品的涵盖超过1,800,000个遗传变异标志物：包括超过906,600个SNP和超过946,000个用于检测拷贝数变化（CNV，Copy Number Variation）的探针:

• 482,000个SNPs来自于前代产品500K和SNP5.0芯片；

• 424,000个SNP包括了源来于国际HapMap计划中的标签SNPs，X，Y染色体和线粒体上更具代表性的SNPs,以及来自于重组热点区域和500K芯片设计完成后新加入dbSNP数据库的SNP；

• 202,000个用于检测5,677个已知拷贝数变异区域的探针，这些区域来源于多伦多基因组变异体数据库。该数据库中的每个3,182个非重叠片断区域分别平均用61个探针来检测；

• 744,000个探针平均分配到整个基因组上，用来发现未知的拷贝数变异区域。

具体应用：除了SNP基因分型之外，还能进行CNV研究。从而能够进行Copy-neutral LOH/UPD检测，亲子鉴定，纯合性分析、血缘关系鉴定。

芯片推荐：Affymetrix Mouse Diversity Genotyping Array

芯片介绍：这款芯片与Human SNP 6.0 芯片类似，既包含SNP探针，也包含CNV探针。一共涵盖623,124个SNP位点和916,269个CNV探针。

Illumina SNP芯片服务

芯片推荐：Illumina Human1M-duo beadchip

芯片内容：Illumina Human 1M- duo芯片中包含了超过一百万个探针信息，可以在一张芯片上平行进行2个样本的检测。该款芯片门包含针对基因SNPs，标签SNPs，拷贝数变化（CNV）,及其他高价值的基因组区域设计探针，同时还增加了一些新的位点，如：增加了疾病相关的SNP位点，灵活的选择一些基因组编码区高密度的SNP 位点。

基因SNPs：约 400,000个SNP 基因区域10kb 覆盖 >99% of RefSeq 基因，约 25,000个非同义 SNPs。

标签Tag SNPs：根据HapMap挑选标签SNP，在r2 > 0.8 前提下，Caucasian (CEU)，Han Chinese/Japanese (CHB/JPT)和Yoruba (YRI)人种中基因组覆盖率分别为95%，94% 和85% 。提供了最高限度的基因组覆盖率，在基因组中平均间隔为 2.4 kb。

CNV 区域：探针覆盖了CNV高发区域如片段复制区域，megasatellites，SNP沙漠，MHC区;覆盖Database of Genomic Variants(DGV)数据库中已报导的CNV区域;特有探针覆盖DGV数据库中尚未报导的CNV区域。

ADME (Absorption, Distribution, Metabolism, Excretion) 基因：包含200个已知ADME 基因中的10,000 SNP。

MHC区域：包含6,000 SNP和indel 标记。

性染色体：38,000个 X 染色体位点, 3,000 Y染色体位点, 400伪常染色体区(PAR)位点。

线粒体 SNP：160 mtSNP。

芯片推荐：Illumina Human 660w-quad beadchip

芯片内容： 该款芯片在一张芯片上可平行进行4个样品的检测，显著的增加了样本输出信息量，减少了实验操作中的误差。该芯片广泛地采用了HumanHap550芯片的内容，以及额外增加了100,000个遗传标记。Human 610-quad涵盖的全基因组信息，对于已知的和新近报道的CNV区域来说都具有权威性。 Human 660w-quad上的SNPs以约5kb的密度均匀分布在基因组上。针对于基因组中高多态性的CNV区域（片段复制区和无SNP的基因组区域），Human 660w-quad设计了一些特异的靶标来进行研究。

芯片推荐：Illumina Human Exon 510S-Duo

芯片内容： Human Exon 10S- Duo包含了约510000个标签SNP。其中330000个标签SNP偏重于基因中央的SNPs和nsSNPs，其他一些有研究价值的标签SNP主要针对于新近报导的CNV区域，与药物代谢有关的基因区域和MHC区域。Human Exon510S-Duo同样可以在一张芯片上平行进行2个样本的检测。Human Exon510S-Duo是HumanHap 550-Duo的辅助产品，将这两款产品联合使用则能提供相当于Human 1M的全部SNP信息。

其它SNP芯片服务

牛全基因组分型芯片服务：Illumina BovineSNP50 Genotyping BeadChip

犬全基因组分型芯片服务：Illumina CanineSNP20 Genotyping BeadChip

马全基因组SNP分型芯片服务：Illumina EquineSNP50 Genotyping BeadChip

猪全基因组SNP分型芯片服务：Illumina PorcineSNP60 Genotyping BeadChip

羊全基因组SNP分型芯片服务：Illumina OvineSNP50 Genotyping BeadChip

玉米全基因组SNP分型芯片服务：Illumina MaizeSNP50 Genotyping BeadChip

肿瘤相关SNP芯片服务

主要组织相容性研究芯片服务

定制SNP芯片服务

芯片推荐： Illumina GoldenGate SNP分型芯片

芯片介绍：可根据您的研究需要挑选SNP位点，制作探针组（OPA），来进行分型研究。

它适用于多种研究，如各种疾病的连锁分析或关联分析；个体化医疗药物遗传学研究；禽畜的育种分型；其他物种（如微生物、植物等等）的遗传学研究等。每个样品了同时检测96,384-1536个SNP位点。

SNP芯片服务信息由上海伯豪生物技术有限公司为您提供，如您想了解更多关于SNP芯片服务报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。

注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途