转录组-ceRNA芯片

芯片简介

一箭三雕，一张芯片同时检测 lncRNA、circRNA、mRNA。

技术特点

稳定：芯片采用 Agilent eArray 平台设计，使用 Agilent SurePrint 技术合成，探针长 60mer，检出率高，技术重复性高于 99%；利用芯片碱基互补杂交的方式，能够比测序技术更灵敏、稳定地对表达丰度较低的 circRNA、lncRNA 进行检测；

超值：芯片覆盖 circRNA、lncRNA、mRNA。一份芯片数据同时提供三个层面的表达信息，circRNA 和 lncRNA 作为典型的内源竞争性 RNA，此款芯片可以让您畅游 ceRNA 调控研究；

特异性高：环状 RNA - 特异的反向剪接位点探针设计，保证每个探针检测的特异性，避免与母基因之间的冗余影响。

仪器平台

Agilent 芯片平台

伯豪优势

成熟的服务平台：稳定而系统的芯片实验全面解决方案，可为客户提供总 RNA 抽提、样品质检、RNA 标记、杂交、洗脱、图像扫描、数据分析等一系列服务。

专业的实验人员：从 RNA 抽提到芯片杂交均配备有专业的实验人员，具有丰富的芯片实验操作经验，遵循严格的质控标准，层层把关确保高质量完成实验。

强大的分析团队：实战经验丰富的分析团队，除能快速完成基础分析外，还能根据客户需求完成个性化分析，提供各类高大上的图表。

稳健的支持团队：一对一服务，为您解决项目全过程中的各类问题，包括但不限于项目方案制定、样本收集、数据结果解读、数据深度挖掘及文章发表支持等。

样本要求

分析流程

案例展示

案例一

研究背景

胶质母细胞瘤（GBM) 是最常见的原发性恶性脑肿瘤，多发生于中枢神经系统，是人类最致命的癌症之一。传统的 GBM 治疗方法术后易复发，预后差，平均存活期约为 15 个月，而个性化治疗往往存在成功率低且副作用大的问题。因此，急需开发新的特别是那些针对复杂基因调控网络的治疗方法。

研究思路

研究结果

本研究利用 ceRNA 芯片（上海伯豪提供）筛选 GBM 中差异表达的非编码 RNA，通过 TargetScan 预测和 pulldown 实验，锁定了研究目标 circRNA—circNT5E。体内外表型研究结果显示 circNT5E 不仅对 GBM 细胞的增殖、凋亡、迁移及侵袭有影响，还能有效促进体内 GBM 肿瘤的形成。功能研究实验结果显示 circNT5E 通过与 miRNA-422a 的结合，解除 miRNA-422a 对其下游靶基因的抑制作用，激活 Akt、Smad2 等信号通路来影响 GBM 细胞的增殖、凋亡、迁移及侵袭。

参考文献

Wang R, Zhang S, Chen XY, Li N, Li JW, Jia RC, Pan YQ, Liang HQ. CircNT5E acts as a sponge of microRNA-422a topromote glioblastoma tumorigenesis. Cancer Res. 2018. 78(17):4812-4825.

案例二

研究背景

肺癌是最常见的癌症，80-85% 的人类肺癌是非小细胞肺癌（NSCLC），其中肺鳞癌（LUSC）和肺腺癌（LUAD）是主要的亚型。目前用于特定基因突变的靶向药物的开发极大地改善了晚期 LUAD 患者的治疗效果，但这一方法对 LUSC 见效甚微。因此，进一步了解 LUSC 发展的分子机制对于开发更有效的治疗方案至关重要。

研究思路

研究结果

研究人员利用 ceRNA 芯片（上海伯豪提供）对 LUSC 及其临近正常组织进行了 circRNA 检测，通过共表达分析及 qPCR 验证，确定目标 circRNA-circTP63。体内外敲减及过表达实验表明 circTP63 能够促进肿瘤细胞增殖和肿瘤生长，且与细胞周期进展相关。共表达分析及 circTP63 敲减 / 过表达分析，确定 FOXM1 为 circTP63 靶基因。进一步生信分析及功能获得 / 缺失实验确定 circTP63 是通过 miR-873-3p 作用于 FOXM1 及下游基因 CENPA 和 CENPB，促进细胞周期的进展，进而促进 LUSC 细胞的增殖和肿瘤生长。

参考文献

Cheng Zhuoan, Yu Chengtao, Cui Shaohua et al. circTP63 functions as a ceRNA to promote lung squamous cell carcinoma progression by upregulating FOXM1.[J] .Nat Commun, 2019, 10:3200.

-END-

产品一 circRNA芯片

筛选差异表达miRNA，差异miRNA靶基因预测。

技术特点

1. circRNA所有探针设计基于国际主流circRNA数据库信息；

2. 环状RNA -特异的反向剪接位点探针设计，保证每个探针检测的特异性，避免与母基因之间的冗余影响。

芯片介绍

产品二 ceRNA芯片

一箭三雕，一张芯片同时检测lncRNA、circRNA、mRNA。

技术特点

1. 稳定：芯片采用Agilent eArray平台设计，使用Agilent SurePrint技术合成，探针长60mer，检出率高，技术重复性高于99%；利用芯片碱基互补杂交的方式，能够比测序技术更灵敏、稳定地对表达丰度较低的circRNA、lncRNA进行检测；

2. 超值：芯片覆盖circRNA、lncRNA、mRNA。一份芯片数据同时提供三个层面的表达信息，circRNA和lncRNA作为典型的内源竞争性RNA，此款芯片可以让您畅游ceRNA调控研究；

3. 特异性高：环状RNA -特异的反向剪接位点探针设计，保证每个探针检测的特异性，避免与母基因之间的冗余影响。

芯片介绍

伯豪特色

1. 成熟的服务平台：稳定而系统的芯片实验全面解决方案，可为客户提供总RNA抽提、样品质检、RNA标记、杂交、洗脱、图像扫描、数据分析。

2. 多样化的服务内容：提供芯片和测序两种高通量检测技术以及低通量检测技术RT-PCR。

3. 专业的实验人员：从RNA抽提到芯片杂交均配有专业的实验人员，丰富的芯片操作经验，确保芯片实验顺利完成。

4. 专业的分析团队：实战经验丰富的分析团队，除能快速完成基础分析外，还能根据客户需求完成个性化分析，提供各类高大上的图表。

案例展示

案例一

放射治疗是肝癌治疗的有效手段之一，然而放射性肝纤维化是肝癌放射治疗的常见并发症，制约肝癌放疗效果。放射性肝纤维化的发病机制仍未明晰，有待进一步研究。环状RNA（circular RNA，circRNA）是一类广泛参与多种生物学进程的非编码RNA，在人类多种疾病的发生和发展中发挥重要作用。本研究通过伯豪生物提供的circRNA芯片对正常和接受放疗的肝星状细胞中差异表达的circRNA进行分析，探讨其在放射性肝纤维化发病过程中的作用，并通过生物信息学分析，挖掘出这些差异表达基因的潜在功能和与miRNA的互作网络，为放射性肝纤维化的研究提供新的思路。

该产品被引用文献

[1] Chen Y, Yuan B, Wu Z, Dong Y, Zhang L, Zeng Z(2017).Microarray profiling of circular RNAs and the potential regulatory role of hsa_circ_0071410 in the activated human hepatic stellate cell induced by irradiation.Gene,2017,629:35-42.
伯豪客户发表的ceRNA芯片部分文章如下（更多文章可以在伯豪官网查找或咨询小编）：
[2]Liu Chang,Ge Hui-Min,Liu Bai-Hui et al. Targeting pericyte-endothelial cell crosstalk by circular RNA-cPWWP2A inhibition aggravates diabetes-induced microvascular dysfunction.[J] .Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2019, 116: 7455-7464. IF=9.50
[3]Zhu Haibo,Guo Jing,Shen Yutao et al. Functions and Mechanisms of Tumor Necrosis Factor-α and Noncoding RNAs in Bone-Invasive Pituitary Adenomas.[J] .Clin. Cancer Res., 2018, 24: 5757-5766. IF=9.13
[4]Renjie Wang, Sai Zhang, Xuyi Chen et al. CircNT5E acts as a sponge of microRNA-422a to promote glioblastoma tumorigenesis. [J] .Clin. Cancer Res., 2018. IF=9.13
[5]Zhang Haiyang,Zhu Lei,Bai Ming et al. Exosomal circRNA derived from gastric tumor promotes white adipose browning by targeting the miR-133/PRDM16 pathway.[J] .Int. J. Cancer, 2019, 144: 2501-2515. IF=7.36
[6]Zhang Haiyang,Deng Ting,Ge Shaohua et al. Exosome circRNA secreted from adipocytes promotes the growth of hepatocellular carcinoma by targeting deubiquitination-related USP7.[J] .Oncogene, 2019, 38: 2844-2859. IF=6.85

转录组-ceRNA芯片信息由上海伯豪生物技术有限公司为您提供，如您想了解更多关于转录组-ceRNA芯片报价、型号、参数等信息，欢迎来电或留言咨询。

注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途