ChIP-Seq全面解决方案

染色质免疫共沉淀技术（Chromatin Immunoprecipitation，ChIP）也称结合位点分析法，是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具，通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。ChIP-Seq的原理是通过染色质免疫共沉淀技术（ChIP）特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段，并对其进行纯化与文库构建，然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。研究人员通过将获得的数百万条序列标签精确定位到基因组上，从而获得全基因组范围内与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段信息。

一、技术路线和方法：

二、生物信息学分析
2.1 基本数据分析
Part01：测序数据质量评估
Part02：reads比对到基因组
Part03：peak查找
Part04：peak全基因组定位
Part05：peak在基因组repeat区域上的统计分析
Part06：peak与Tss等位点距离分析
Part07：peak附近区域序列提取及motif分析
2.2 高级数据分析
Part08：peak所在基因的COG/KOG功能分类（对植物）
Part09：peak所在基因的GO功能分类
Part10：peak所在基因Pathway分析
Part11：peak所在基因互作网络构建
Part12：差异分析（对双通道）

三、二代测序平台

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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途