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客户文章 | BIOTREE蛋白质组学客户文章集锦
客户文章分类
01.医学方向
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1. 通过调节微环境和代谢选择性对抗缺氧肿瘤的高效Pt（IV）前药研究
发表期刊：Angewandte Chemie International Edition
发表时间：2020
影响因子：12.959
作者单位：中山大学
涉及的百趣服务产品：iTRAQ标记定量蛋白组
样本类型：人细胞
主要研究内容：
缺氧和酸性微环境在肿瘤转移和血管生成中起着至关重要的作用，通常会损害化疗效果。作者开发了两种靶向碳酸酐酶IX（CAIX）的铂（IV）前药CAIXplatins，采用iTRAQ蛋白组等实验方法研究了其设计的合理性和功效，结果表明CAIXplatins对CAIX有着很强的亲和力和抑制性，不仅可以克服肿瘤缺氧和酸性微环境的问题，也可以抑制缺氧癌细胞的代谢通路， 而且CAIXplatins的肿瘤选择性是顺铂/奥沙利铂的70~90倍，其全身副作用也得到了有效缓解，因此具有非常广阔的临床应用前景。
2. 慢性低氧诱导的Cirbp高甲基化会弱化低温状态下的心脏保护作用
发表期刊：Science Translational Medicine
发表时间：2019
影响因子：16.71
作者单位：中国医学科学院阜外医院
涉及的百趣服务产品：iTRAQ标记定量蛋白组
样本类型：大鼠心脏组织
主要研究内容：
在体外循环（CPB）期间通常使用治疗性低温来保护心脏免于心脏手术中的心肌损伤。而患有慢性缺氧（CH）的患者在心脏手术后具有严重心肌损伤的高风险，但其潜在机制尚不清楚。文章首先利用iTRAQ蛋白质组学研究发现了Cirbp信号轴中的多个重要蛋白，并在此基础上进行深入的分子生物学研究。结果表明CIRBP-COQ6/9-CoQ10轴受损是造成Cirbp-/-大鼠严重心肌损伤和术后心功能不全的原因，而CoQ10补充的心脏停搏液改善CH大鼠的心脏保护作用。这是一项非常具有临床意义的研究，为CH患者提供了个性化心脏保护策略的潜在可能性。
Analysis of the role of palmitoleic acid in acute anterior uveitis
发表期刊：International Immunopharmacology
发表时间：2020
影响因子：3.943
作者单位：重庆医科大学附属第一医院
涉及的百趣服务产品：GC-MS、TMT标记定量蛋白组
样本类型：人粪便、细胞
主要研究内容：
作为最常见的葡萄膜炎实体，急性前葡萄膜炎（AAU）损害眼睛前段的正常功能和结构，前期研究发现患者与健康人之间粪便中棕榈烯酸（PA）浓度存在显著差异，本文主要使用GC-MS和TMT定量蛋白组等方法在体内体外实验中探讨PA在 AAU发病中的作用，结果表明AAU患者粪便中PA的表达明显增加。PA在临床和实验葡萄膜炎的发病机制中都起着作用。其作用可能是通过改变树突状细胞和CD4+T细胞的功能和分化来介导的。PA在小鼠模型中对树突细胞和CD4+T细胞有免疫调节作用，并减轻疾病的严重程度。
02.食品方向
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1. 宣威火腿中修复HHL-5肝细胞氧化应激损伤的活性肽的分离与鉴定
发表期刊：Food & Function
发表时间：2020
影响因子：4.171
作者单位：合肥工业大学
涉及的百趣服务产品：多肽组
样本类型：猪多肽溶液
主要研究内容：
宣威火腿中提取的肽（XHP）具有预防自由基引起的疾病的作用，本研究采用色谱法对XHP进行分离获得最有效成分，多肽组检测该肽序列为asn - pro - pro - lysl - phep - asp （NPPKFD）六肽。此外，还揭示了NPPKFD预防酒精诱导的氧化应激损伤的分子机制。结果表明，该六肽可通过激活NrF2/HO-1通路，下调CYP2E1的表达，减少ROS的生成，增强氧化防御系统。表明宣威火腿可作为一种新的保护酒精性肝损伤的生物活性肽来源。
2. 高静水压力（HHP）对亚麻籽胶（PG）糖化大豆分离蛋白溶解度和构象变化的影响
发表期刊：Food Chemistry
发表时间：2020
影响因子：6.306
作者单位：东北农业大学
涉及的百趣服务产品：Label free定量蛋白组学
样本类型：大豆粉末
主要研究内容：
大豆蛋白由于其具有较高的商业价值和营养价值，常被作为食品行业的配料或添加剂使用，现有的加工方法限制了大豆分离蛋白（SPI）在食品加工中的功能特性。文章使用label free定量蛋白组等方法研究了HHP对湿法加热SPI和FG之间美拉德反应的影响及SPI溶解度和构象的变化。结果表明，与FG糖基化后SPI的溶解度提高。SPI-FG糖基化的发生、程度和位点表明，中等压力（100 MPa）显著促进美拉德反应，而较高压力（大于200 MPa）则抑制美拉德反应。总的来说，HHP代表了一种控制糖基化以改善蛋白质加工性能并扩大其在食品工业中的适用性的潜在方法。
03.微生物方向
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1. 黑曲霉热胁迫响应机制研究
Proteomic analysis of Aspergillus niger 3.316 under heat stress
发表期刊：MicrobiologyOpen
发表时间：2020
影响因子：3.142
作者单位：河北科技师范学院
涉及的百趣服务产品：PRM靶向蛋白组
样本类型：黑曲霉
主要研究内容：
在工业发酵环境中，黑曲霉生产β-葡萄糖苷酶伴随着温度的升高，而目前对黑曲霉热应激反应(HSR)机制的了解还不完全。本研究采用两种蛋白质组学方法（iTRAQ和label free）研究了T组（50°C胁迫）和C组（30°C对照）黑曲霉3.316的细胞内蛋白质组谱，并采用平行反应监测(PRM)方法检测了4种蛋白的表达。结果表明在热胁迫条件下，黑曲霉3.316中具有保护和修复功能的蛋白的相对表达量上调。这些蛋白参与代谢途径、氧化磷酸化、卟啉和叶绿素代谢、丙酮酸代谢和柠檬酸循环（TCA循环）。从蛋白质组学和生物信息学分析中获得的见解可用于进一步探索黑曲霉的HSR机制。
发表期刊：RSC Advances
发表时间：2020
影响因子：3.119
作者单位：吉林大学
涉及的百趣服务产品：TMT标记定量蛋白组、LC-MS/MS非靶代谢组学
样本类型：大肠杆菌
主要研究内容：
在本研究中，应用TMT蛋白质组学和代谢组学的联合分析来比较β-内酰胺类抗生素敏感大肠杆菌和产超广谱β-内酰胺酶大肠杆菌（ESBL-EC）菌株之间蛋白质和代谢物的差异，结果表明超广谱β-内酰胺酶的存在影响大肠杆菌的代谢物和蛋白质谱，差异蛋白和差异代谢物可能在ESBL-EC的抗生素耐药性中起重要作用。该研究可以在代谢物和蛋白质水平上为ESBL-EC抗生素耐药性的机制研究提供科学数据，针对这些途径的调节剂可能对ESBL-EC菌株的治疗有效并揭示临床大肠杆菌菌株的抗生素抗性机制。
04.毒理方向
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山奈酚预处理对脱氧雪腐镰刀菌烯醇诱导的Caco-2细胞肠道屏障功能障碍的保护作用机制研究
发表期刊：Food & Function
发表时间：2020
影响因子：4.171
作者单位：江南大学
涉及的百趣服务产品：Label free定量蛋白组学
样本类型：细胞
主要研究内容：
脱氧雪腐镰刀菌烯醇（DON）是食物链中常见的真菌毒素之一，有较多证据表明其对肠道稳态的毒性有影响。山奈酚（KAM）是一种广泛存在于水果和蔬菜中的天然多酚抗氧化剂，在预实验中发现KAM是防止DON暴露时Caco-2细胞单层屏障功能失调的最有效试剂。本文采用label free蛋白质组学方法研究了 KAM预处理对Caco-2细胞模型中由DON诱导的屏障功能障碍的保护作用，结果表明KAM预处理通过PKA通路和MAPK/ERK通路影响紧密连接和粘附连接蛋白的表达和组装，从而提高Caco-2细胞单层屏障的完整性，为降低DON毒性效应的策略的发展提供理论基础。
05.植物方向
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发表期刊：Journal of Proteomics
发表时间：2021
影响因子：3.509
作者单位：浙江农林大学
涉及的百趣服务产品：Label free定量蛋白组学、GC-TOF-MS代谢组学
样本类型：叶片
主要研究内容：
油菜菌核病是一种常见的油菜病害，由植物坏死病原菌核盘菌引起。褪黑激素（MT）具有已知的生物活性，能有效缓解油菜的这种菌核病。文章采用蛋白质组学和代谢组学技术研究MT诱导的油菜菌核病菌抗性的分子机制。结果表明，油菜叶片促进硫胺素的形成，以抵御核盘菌感染。此外，金属硫蛋白有助于以三磷酸腺苷依赖的方式进一步诱导油菜中的抗氧化剂活化，并刺激谷胱甘肽生物合成以很好地抑制核盘菌感染。研究结果将为MT诱导的抗真菌机制提供见解，并为减轻这种疾病提供新的治疗策略，从而提高植物产量，减少经济损失。
注：仅列出部分方向部分文章做简要展示，后续会持续更新哦