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样本收集手册 | 植物类样本的收集方法及注意事项
各位老师、同学，大家好。今天将要分享的是我们样本收集手册的第五弹——植物类代谢组学样本收集参考步骤。本次，我们将详细介绍植物类样本（叶片、茎、花、根、果实、种子）的收样方法及注意事项。做植物代谢方向的老师可千万不要错过。话不多说，我们干货奉上。
1.叶片、茎、花
样品量要求：
GC-MS，LC-MS 实验：200mg/sample。
顶空 GC-MS 实验：2g/sample。
样本收集步骤：
取整片叶片/一段茎/一朵花，用锡箔纸包裹并标记后，迅速放入液氮中冷冻处理至少 15min。取出后迅速放入自封袋中（每组一袋），在自封袋中放入标签纸注明样本信息。迅速放入-80℃冰箱冻存。足量干冰寄送。
注意事项：
1. 采集叶片样本时，最好在中午光照好的时间收集。
2. 要根据实验设计，采集样本时保持样本一致性，尤其是同一组样本（颜色、衰老程度、叶脉占比、光照、位置等）。
3. 由于锡箔纸上 marker 笔标记容易模糊，所以需要在自封袋中放入标签纸注明。
2.根
样品量要求：
GC-MS，LC-MS 实验：500mg/sample。
顶空 GC-MS 实验：3g/sample。
样本收集步骤：
1. 取整株植物的根部，迅速用 1×PBS 漂洗掉根上的泥土。
2. 根据具体实验设计取植株根特定的部位，500 mg/sample 装入离心管中。
3. 标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少 15min。
4. -80 度冻存；足量干冰寄送。
注意事项：
1. PBS 漂洗时间要尽快。
2. 由于根部组织特别脆弱，被挤压后会变成浆糊状，所以推荐保存至离心管中，而不是锡箔纸包裹。
3.果实、种子
样品量要求：
GC-MS，LC-MS 实验：200~500mg/sample。
顶空 GC-MS 实验：3g/sample。
样本收集步骤：
1. 对于含多汁、块头较大的果实（番茄、西瓜、苹果等）需要先用锋利的刀分割成“均匀”合适的小块（≈200 mg/sample）分装至 2mL 离心管中，标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少 15min。
2. 对于细小的颗粒种子（拟南芥种子、谷物种子等），可以先将同一组的植株种子混匀后再分装（≈200 mg/sample）至 1.5mL 离心管中。标号后迅速放入液氮中冷冻处理至少 15min。
3. 对于要求对整个果实进行提取的（整粒葡萄等），需要把果实装在 50mL 离心管中/自封袋中，标号后（同时放入自封袋中标签纸，注明样本信息）迅速放入液氮中冷冻处理至少 15min。
注意事项：
对多汁的果实进行取样很难保持均一性（如番茄，皮、果肉、果瓤、籽的占比）， 强烈建议将整个果实进行研磨、冻干，对粉末进行称重分装。
收集方法参考文献：
[1] De Vos R C, Moco S, Lommen A, et al. Untargeted large-scale plant metabolomics using liquid chromatography coupled to mass spectrometry.[J]. Nature Protocols, 2007, 2(4):778-791.
[2] Kim H K, Choi Y H, Verpoorte R. NMR-based metabolomic analysis of plants[J].Nature Protocols, 2010, 5(3):536-49.
最后附上我司协助客户发表的植物样本部分文献，以便各位老师、同学在设计课题、文章撰写等环节可参阅和引用。
| 标签： | 样本收集 植物 |