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Affymetrix全基因组SNP芯片检测

参考报价: 面议 型号: Affymetrix全基因组SNP芯片检测
品牌: 博奥晶典 产地: 北京
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AI问答
可以做哪些实验,检测什么? 可以用哪些耗材和试剂?

Affymetrix全基因组SNP芯片检测

简介

   单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP) 指基因组单个核苷酸的变异,它是最微小的变异单元,是由单个核苷酸对置换、颠换、插入或缺失所形成的变异形式。单核苷酸多态性是基因组上高密度的遗传标志,在人类基因组中已发现的SNP数量超过3000万。作为第三代遗传标记,SNP数量众多、分布密集、易于检测,因而是理想的基因分型目标。SNP分型检测在疾病基因组(如疾病易感性),药物基因组(药效、药物代谢差异和不良反应)和群体进化等研究中具有重大意义。 在人研究方面,Affymetrix 公司有分别基于GeneChip和GeneTitan平台的 SNP 6.0 芯片和针对中国人群设计的CHB1&2 Array,既可用于全基因组SNP分析,又可用于CNV分析,极大地方便了中国人类疾病GWAS研究。Affymetrix公司针对多个农业物种也开发了多款商品化的基因分型芯片,如鸡、牛、水牛、鲑鱼、水稻、小麦、辣椒、草莓等,为农业育种研究、遗传图谱构建、群体基因组学研究提供研究手段。此外,Affymetrix公司还支持定制芯片,最低起订量为480个样品。

检测原理

  基于GeneChip平台的人SNP 6.0 芯片实验流程:

        

 

  基于GeneTitan平台的Axiom基因分型芯片检测流程:

       

 

技术优势

SNP和CNV兼容检测:同一种芯片即可用于SNP检测,又能用于CNV分析;
高覆盖率:具有极高的全基因组探针物理覆盖率,检测的遗传标记间中位距离为680 bp;
高重复性:独特的芯片设计保证了高重复性和检测一致性;
完善的实验室条件:博奥生物专业的分型实验室条件,合理布局和气压控制,防止PCR产物污染;
严格的服务管理:博奥生物分型实验室具有多套仪器设备备份,操作熟练而稳定的技术员团队,运行严格的管理体系;
丰富的服务经验:博奥生物具有丰富的技术服务项目经验。

产品列表

物种产品编号产品名称和适用平台数据库来源检测位点数量
AFF-901764AxiomTM Genome-Wide CHB1 Array Plate (GeneTitan平台)来源于HapMap, dbSNP, 和1000 Genomes Project数据库640,673

AxiomTM Genome-Wide CHB1&2 Array Plate (2张芯片/set,GeneTitan平台)来源于HapMap, dbSNP, 和1000 Genomes Project数据库1,296,521
AFF-901640AxiomTM Genome-Wide ASI 1 Array Plate (GeneTitan平台)来源于HapMap, dbSNP, 和1000 Genomes Project数据库600,307
AFF-901153Genome-Wide Human SNP array 6.0 (GeneChip平台)SNPs: 482,000个SNPs源于品500K和SNP5.0芯片; 424,000个SNP源于HapMap计划中的tag SNPs,X,Y染色体和线粒体上具代表性的SNPs;dbSNP数据库;重组热点区域;CNVs:源于多伦多基因组变异体数据库的5,677个已知拷贝数变异区域,202,000探针。平均分配到整个基因组上,用来发现求知的拷贝数变异区域的744,000个探针。906,000 SNPs+946,000 CNVs
AFF-901791AxiomTM Genome-Wide BOS1 Array Plate (GeneTitan平台)来源于Affymetrix Bovine Consortium,对20多种品系收集的超过3百万个经实验确认的SNPs位点648,855
水稻
Rice 44K SNP Genotyping Array (GeneChip平台)与Cornell University的Dr. Susan R.McCouch合作开发44,100


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注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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