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组学社区福利!重磅回看- HUPO 2020 赛默飞用户会

发布时间: 2020-11-16 13:32 来源:赛默飞色谱与质谱分析

组学社区福利!重磅回看- HUPO 2020 赛默飞用户会

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HUPO作为蛋白质组学的国际盛会,每年都会成为业内关注的焦点。2020 年受到全球新冠疫情影响,转战线上,并新命名Connect。在这场代表蛋白质组学ding尖水平的盛会上,有哪些令人耳目一新的新技术,又哪些让人眼前一亮的新应用?许多错过现场精彩内容的老师一定有所遗憾。作为组学社区的福利之一,我们将为您回放HUPO 2020之中一场看点颇多的赛默飞用户会:Accelerating COVID-19 Proteomics Research Using Tandem Mass Tags,让您不再错失精彩!

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看点直击

 

看点一:TMT 定量分析

 

TMT标记定量助力新冠研究

TMT标记定量方案拥有更优的分析速度、覆盖深度和定量质量;并可灵活与SILAC标记技术联用,进行快速蛋白差异分析。

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图1. 多重增强蛋白质动力学(multiplexed enhanced protein dynamicsme, mePROD)实验流程(点击查看大图)

它的价值在于提升蛋白质组的解析深度;一次性在多个样品中量化蛋白水平的差异,定量准确性更高;适用于更复杂的大样本实验设计,有效地缩短了实验时间,加速确证病毒致病性相关的生物途径以及寻找潜在的药物靶标。

 

看点二:直击新冠

COVID-19研究热点话题与成果展示

借助TMT实验流程,能够从多角度分析SARS-CoV-2蛋白组学,进而全面了解在新冠发展进程中,SARS-CoV-2病毒的感染机制、宿主细胞信号通路的改变、轻重症患者免疫反应,以及COVID-19zhi疗药物的潜在靶点。

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图2. SARS-CoV-2引起的免疫相关蛋白变化(点击查看大图)

 

 

看点三:多种冠状病毒的横向分析

基于亲和纯化质谱技术(AP-MS)和TMT流程,比较SARS-CoV-1和SARS-CoV-2、MERS-CoV非结构同源蛋白与宿主蛋白的相互作用,量化不同病毒间 Nsp2、Nsp4及Nsp3同源蛋白的差异并进行富集分析。

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图3. 病毒-宿主蛋白互做关系

借助AP-MS的特异性与TMT的高通量优势,可以目标性地开展蛋白互作图谱分析,帮助揭示了SARS-CoV-1、SARS-CoV-2、MERS-CoV之间共享/独特的病毒-宿主依赖关系 ,非结构蛋白驱动的病毒复制和致病性,调节蛋白稳态用于疾病干预zhi疗。

完整内容

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