Thermo蛋白质组学与精准医学基础培训班

培训班介绍

随着我国精准医疗计划的全面启动，包括肿瘤、心脑血管、代谢性疾病、免疫性疾病及罕见病等多种高发重大疾病被列入精准医学的研究范畴，通过对基因组、转录组、蛋白质组及代谢组等多组学数据的深度整合和深度挖掘，并结合多种临床数据，希望实现精准的疾病分类和诊断，制定具有个性化的疾病预防和诊疗方案。在迈向精准医疗的道路上，蛋白质组学扮演了重要的角色：它是基因组的表型，更接近生命活动的当下状态，更合适作为一个动态的生化指标，更直接地判断疾病的发生和发展！随着肿瘤研究领域基因组与蛋白质组的深度对接，蛋白质组的临床转化之路在摸索中发展，在发展中加速！而高通量质谱实验技术及数据分析方法的不断成熟与更新，进一步激发了蛋白质组学在精准医学领域的发力和突破！

为了更好地交流分享基于蛋白质谱的蛋白质组学在精准医学领域的最新实验技术、数据分析方法，以及具有代表性的应用实例，赛默飞世尔科技与上海康昱盛公司以及克里克学院合作推出了本次培训班，于2016年7月9日-10日、16日-17日、30日-31日，分别于上海、北京和广州举办。培训课程包括基础课程和应用课程两个部分，邀请了中国科学院计算技术研究所蛋白质谱数据算法专家、赛默飞世尔资深应用科学家、康昱盛公司高级应用科学家，为大家讲授从样品制备、质谱实验到数据处理、深度分析以及相关数据库使用的基础知识，并有幸邀请到分别来自复旦大学医学院、上海交通大学医学院、北京协和医学院、清华大学生命科学学院、暨南大学生命科学技术学院的多位专家教授，为大家介绍最前沿的临床应用，分享他们多年沉淀的宝贵科研经验和令人瞩目的科研成果！

本次培训班面向对蛋白质组学感兴趣的医学及临床科研人员，以及参与临床合作研究的蛋白质组学基础科研人员以及生物信息学研究人员，同时欢迎有志于投身临床蛋白质组学及精准医学领域的研究生及本科高年级学生。为满足广大同行的培训需求，同时控制人数，保证培训质量，本次培训班计划在上海、北京及广州各办一场，每场时间为两天，第一天及第二天下午的课程相同，第二天上午应用课程的授课老师和授课内容各不相同，请有意报名的学员注意查看每一场课程安排的详细情况，以便选择最合适自己的场次。若有任何问题，欢迎通过电话或邮件等方式联系组委会工作人员，我们会竭诚为您服务，并热烈期盼您的参加！

授课老师简介

邓海腾 教授 博导 清华大学生命科学学院

1985年和1988年先后获武汉大学学士和硕士学位。1996年在美国宾夕法尼亚州立大学获博士学位。先后在加拿大阿尔伯特大学和美国橡树岭国家实验室从事博士后研究。2000年至2003年在美国爱因斯坦医学院及内布拉斯加大学担任助理教授。2004年至2010年在美国纽约洛克菲勒大学任研究副教授及蛋白质组学中心主任。2011年至今任清华大学生命科学学院教授，并兼任美国洛克菲勒大学客座教授和纽约大学客座研究员。研究方向：质谱和蛋白质组学及代谢组学 ，包括研究蛋白质修饰和蛋白质复合物在免疫细胞分化和免疫应答的作用机制，应用蛋白质组学及代谢组学以发现癌症和传染病的早期诊断的分子标志物和药物靶点等。

高友鹤 教授 博导 中国医学科学院基础医学研究所/北京师范大学

1990年获中国协和医科大学医学博士（MD） 1997年获美国康涅狄格大学生物医学博士（PhD）。1997-2001美国哈佛医学院博士后、讲师。2001年起获聘中国医学科学院特聘教授，任基础医学研究所病理生理学系教授。 全国优秀博士论文指导教师，中国生化分子生物学会蛋白质组学分会常务理事，杰出青年基金获得者，国务院学位委员会第六届学科评议组基础医学组成员，新世纪百千万人才工程国家级人选，国务院政府特殊津贴。 研究方向：尿蛋白生物标志物；器官灌流在生物标志物研究上的应用；蛋白质相互作用方法的研究；蛋白质组学数据的生物信息学；非常规蛋白相互作用研究。

     田瑞军，南方科技大学研究员，加拿大渥太华大学医学院兼职教授，博士生导师（香港浸会大学、香港科技大学-南方科技大学联合博士培养项目）。

2008年在中国科学院大连化学物理研究所获得分析化学博士学位，并获得中国科学院院长优秀奖和中国科学院优秀毕业生奖励。同年加入加拿大渥太华系统生物学研究所进行博士后研究。2010年加入加拿大多伦多大学和西奈山医院继续博士后研究，师从Tony Pawson院士，并获得加拿大国立卫生研究院（CIHR）博士后基金资助。2014年起受聘南方科技大学化学系研究员。致力于蛋白质组学的方法学和应用研究，在细胞信号转导、肿瘤微环境和干细胞定向分化等生物医学方向开展了卓有成效的应用研究。已在国际主流学术期刊上发表论文近40篇，其中以责任作者在PNAS、Mol. Cell. Proteomics、Anal. Chem.、Angew Chem.等上发表文章近20篇，SCI他1000余次，H-index为20。曾荣获深圳市海外高层次人才“孔雀计划” B类人才（2014）、由国际蛋白质结构分析和蛋白质组学协会（IAPSAP）颁发的2012 Young Investigator Award，并在第八届世界蛋白质组学大会（HUPO）等做邀请或口头报告30余次。曾担任第二届中国蛋白质组组织（CNHUPO）第二届青年学者研讨会执行主席。目前担任Scientific Reports (Nature Publishing Group)、Frontiers in Endocrinology和Austin Proteomics三种国际期刊的编委会委员职务。

王立顺 研究员 博导 复旦大学附属闵行医院中心实验室主任，复旦大学生物医学研究院研究员，上海化学生物学E-研究院研究员

2000年在白求恩医科大学获得硕士学位，2003年在吉林大学获得博士学位。期间，2001年7月-2003年12在中国科学院北京基因组研究所蛋白质组学研究中心工作，参与人类重大疾病及动植物的蛋白质组学研究，2003年作为研究集体主要完成者之一获得2003年度中国科学院杰出科技成就奖。2004年3月作为重要学术骨干加盟上海交通大学附属瑞金医院，参与蛋白质组学平台建设，开展疾病蛋白质组学研究；2007年获得上海市医学科技一等奖；2008年入选上海市科技启明星；2010年被上海交通大学医学院聘为研究员。2015年作为蛋白质组学领域学术带头人，加盟复旦大学，担任复旦大学附属闵行医院中心实验室主任，复旦大学生物医学院研究院研究员。研究方向：药物蛋白质组学和化学蛋白质组学。 

     王通 研究员 博导 暨南大学生命科学技术学院

1993-1997年，于厦门大学生物系获理学学士学位；1997-2000年，于华南农业大学植物学专业获理学硕士学位;2001-2004年，于暨南大学生物医学工程专业获理学博士学位。2004-2006年，于暨南大学生命科学院任助理研究员，研究方向免疫细胞凋亡和线粒体毒性。2008-2009 美国University of Washington School of Medicine，Senior Fellow；2006-2008 美国University of Nebraska Medical Center，博士后；2004-2014 暨南大学生命科学技术学院/生命与健康工程研究院助理研究员，副研究员；2014-至今 暨南大学生命科学技术学院/生命与健康工程研究院，研究员。研究方向 ：感染、炎症与癌症；分子系统生物学。

         库鑫 博士 助理研究员 上海交通大学系统生物医学研究院

2007年毕业于华中科技大学同济医学院，获学士学位。同年9月被保送至中科院上海药物研究所并于2010年取得硕士学位。2010年10月至2014年6月在德国慕尼黑工业大学（Technische Universität München）生物分析与蛋白质组学研究所（Prof. Bernhard Kuster）攻读博士学位，专业方向为基于串联质谱的蛋白质组学在肿瘤药物研究中的应用。库鑫在博士期间发展了基于定量质谱的化学蛋白组学方法用于近生理条件下激酶小分子药物脱靶效应的研究，相关结果发表于J Prot Res, J Prot等杂志上。现任职于上海交通大学系统生物医学研究院，研究方向：肿瘤相关生物标志物的发现和蛋白质糖基化修饰的研究。

     刘超 助理研究员 博士 中国科学院计算技术研究所

自2007年起，刘超博士在中科院计算所pFind团队从事蛋白质组学相关的算法设计、软件开发和数据解析研究，主攻方向为定量蛋白质组学，开发了蛋白质定量数据分析软件pQuant。2015年，国际科研权威机构ABRF组织了蛋白质组学非标记定量数据分析评测（iPRG2015），在全球51组参评结果中，刘超博士提交的分析结果不但蛋白质定量数目最多，而且报告差异蛋白质的定量准确度第一。刘超博士曾参与了多项973、863等科研项目，并曾与美国John Yates教授实验室等国内外实验室合作发表多篇论文。

     蒋好 博士 赛默飞世尔科技质谱应用工程师

2009年毕业于复旦大学应用化学专业，获理学学士学位。同年保送至中国科学院大连化学物理研究所攻读博士学位，师从张玉奎院士和张丽华研究员，2016年获得分析化学理学博士学位。主要开展的工作包括糖基化蛋白质组学的研究、集成化样品预处理分析平台的构建和组蛋白及其翻译后修饰的分析。熟悉基于生物质谱的蛋白组学常用分析、鉴定与定量流程，在液质联用(LC-MS)技术的应用方面具有一定的经验。2016年加入赛默飞世尔科技(中国)有限公司。

唐家澍 博士 赛默飞世尔科技质谱应用工程师

2006年毕业于南京大学理科强化部，生物化学专业，获得学士学位。2013年毕业于中科院上海生化所，师从曾嵘研究员，主要从事蛋白质组学技术和应用研究。随后在中科院上海生科院系统生物学重点实验室进行了为期两年的博士后训练，主要从事系统生物学和基于分子生物学的功能研究。从2016年1月开始，在赛默飞世尔科技色谱质谱事业部担任应用工程师，主要擅长磷酸化蛋白质组学技术，定量蛋白质组学技术以及质谱数据的生物统计学和生物信息学分析。

周岳 博士 赛默飞世尔科技质谱应用工程师

毕业于中国科学院生物物理研究所，致力于蛋白质组学，生物制药的应用开发，技术支持和科学研究工作。在生物质谱蛋白定性分析，翻译后修饰以及蛋白定量方面有丰富的经验，参与完成多篇高水平文章的质谱工作。在赛默飞世尔科技担任质谱应用工程师期间，优化了QE系列产品，fusion系列产品在蛋白质组学应用中的质谱参数，并在Orbitrap用户中进行推广。建立了基于QE, Fusion的DIA数据采集以及数据分析流程，实现了7500个蛋白的DIA定量分析。

沈诚频 博士 康昱盛信息科技有限公司高级应用科学家

2005年毕业于复旦大学化学系，获得理学学士学位；同年保送至复旦大学生物医学研究院攻读博士学位，师从复旦大学生物医学研究院常务副院长杨芃原教授，2011年获得理学博士学位，攻读博士学位期间，作为访问学者于2009年-2011年前往美国麻省理工大学生物工程系交流学习。主要开展的工作包括：人肝蛋白质组学，蛋白质组学信息学，糖蛋白质组学。于2011年作为应用科学家加盟康昱盛信息科技有限公司生物信息学部，并于2013年聘为公司高级应用科学家及生物信息学部主管，主要负责蛋白质组学及生物通路分析软件和方法的技术支持及方案咨询。

详细课程安排

2016年7月9日（上海站） 7月16日（北京站） 7月30日（广州站）周六  

8:00 – 9:00        注册

9:00 – 9:15        开班仪式

9:15 – 10:00       临床蛋白质组学样品前处理

                 —临床细胞、组织样本前处理

                 —临床体液样本前处理（血浆、尿液等）

                 —临床小量样本前处理（LCM等）

                 —蛋白质复合物免疫沉淀

                 —蛋白质酶解、除盐、分级等

                 —修饰肽段富集（磷酸化、糖基化等）

                 —蛋白质组学定量方法

10:00 – 10:45      临床蛋白质组学质谱分析一

                 —蛋白质质谱分析基础

                 —Oribtrap质谱技术简介

                 —未知蛋白质与后修饰鉴定

10:45 – 11:00      茶歇

11:00 – 12:00      临床蛋白质组学质谱分析二

                 —表达差异比较与标记物发现

                 —样本数字化与标志物验证

                 —目标蛋白定量与临床检测

12:00 – 13:30      午餐及午休

13:30 – 14:15      蛋白质质谱数据基础知识

                 —蛋白质质谱数据类型及格式

                 —蛋白质质谱谱图原理及介绍

                 —蛋白质质谱数据采集策略介绍

14:15 – 15:15      蛋白质定性数据解析要点

   —肽谱匹配基本原理

  —搜库参数设置优化 

                                     —谱图信息的深度解析

15:15 – 15:30      茶歇

15:30 – 16:15      蛋白质定量数据解析要点

                             —定量技术介绍  

                             —定量算法及软件介绍  

                             —精确定量面临的挑战

16:15 – 17:00      数据解析流程及统计分析 

                                   —肽段到蛋白质的归并

—显著性计算及差异表达蛋白质

—论文中常见的统计描述错误及更正方法

17:00 – 17:30      答疑

2016年7月10日（上海站） 7月17日（北京站） 7月31日（广州站）周日

9:00 – 10:20       专题报告：

                             基于化学蛋白质组学的药物靶点鉴定（上海站）

                             Finding Molecular Mechanisms underlying Tumorigenesis and Progression from Proteomic Data （北京站）

                             蛋白质组学在生物医学中的应用研究策略（广州站）

10:20 – 10:40      茶歇

10:40 – 12:00      专题报告：

                            全息式质谱采集技术用于发现非小细胞肺癌早期诊断标志物 （上海站）

                            尿液是早期敏感的生物标志物来源（北京站）

                            肿瘤微环境的蛋白质组学研究 （广州站）

12:00 – 13:30      午餐及午休

13:30 – 14:45      蛋白质组学常用数据库及使用方法

                            —介绍常用的蛋白质组学数据库的特点，应用范围及操作方法

14:45 – 15:45      蛋白质数据的深度注释与生物通路分析

                 —蛋白功能注释与生物学效应分析

                 —蛋白质的功能异常与疾病的关联

                 —蛋白与蛋白及蛋白与小分子相互作用网络

                 —蛋白上游调节因子

15:45 – 16:00      茶歇                          

16:00 – 17:00      蛋白质组学与其它组学数据的关联分析

                             —蛋白质组学与转录组学关联分析

                            实例解析

                             —蛋白质组学与代谢组学关联分析

                             实例解析

17:00 – 17:30      答疑

如何报名

请通过我们的网站直接报名：

http://www.cloudscientific.com/plus/view.php?aid=194

如果您没有在我们的网站上注册过，请先注册一下，即可进入报名页面。

注：您提交报名信息后，我们会在一个工作日内回复您，如果您报名后第二天仍然没有收到回复邮件，请联系培训班组委会查询登记情况，培训组委会联系方式如下：

联系人：徐玉仙

Mob: 13764231640

Tel: 021-54975000-811

Email: marketing@cloudscientific.com

课前准备及相关事项

1. 蛋白质组学基础理论学习，供有需要的学员参考，可在参加培训班之前自学

  推荐资料：http://wenku.baidu.com/view/bc8d6df583c4bb4cf7ecd1ef.html?from=search 

2. 课程资料将以打印文件的形式分发到参会者手中。

价格及相关事项

收费标准为：工业2500元/人，学术、科研人员1800元/人，学生1500元/人。

2016年6月11日前可享受优惠价：工业2000元/人，学术、科研人员1500元/人，学生1200元/人。

说明：此费用包括除Thermo公司提供的课程以外的所有课程的培训费、资料费、中午工作餐及茶歇，包括交通、住宿有其它餐饮。Thermo公司提供的课程免费，其产生的费用已从收费价格中扣除。

撤销注册及申请退款

已经付款的参会员，若临时有事不能前往，提前45天以上通知我们，可退还50%的费用；提前一个月以上通知，可退还20%的费用。培训前开始前一个月则不再接受退款申请，您可以邀请其它同事代替您参加。

付款方式

1、支付宝账号

名字：上海康昱盛信息科技有限公司

账号：358548977@qq.com 

2、 网上汇款或银行转账

我司银行卡的信息为：

户名：上海康昱盛信息科技有限公司

帐号：31001632504052511198

开卡银行：建行上海体育场支行

如果您是柜台转账，请把转账票据拍照后邮件发给我们，邮箱地址：marketing@cloudscientific.com

如果您是网上转帐，请截取相关的图片发邮件给我们，

如果您是支付宝支付，请在备注里注明您的姓名+单位+培训班名称

收到款后我们会与您电话或E-mail确定。培训当天我司会根据您的要求为您开据发票。

培训地点及乘车路线

1. 上海站

--培训地点：

复旦大学生物医学研究院  上海市徐汇区医学院路138号

上海市徐汇区东安路131号复旦大学生物医学研究院明道楼二楼会议室

从东安路校门进入，向前走50米左右，右手边第二幢楼即是。

--乘车路线：

◇ 虹桥机场/虹桥高铁站出发：地铁2号线，在静安寺下车，站内步行200米，乘地铁7号线，到肇嘉浜路站下车（3号出口），步行260米到达。（18公里，约1小时）

◇ 浦东机场出发：乘机场磁悬浮在龙阳路站下车，站内步行200米，乘地铁7号线，到肇家浜路站下车（3号口出），步行391米到达。（44公里，约47分钟）

◇ 上海南站出发：地铁3号线，宜山路站下，站内步行200米，乘地铁9号线，到肇家浜路站下车，步行637米到达。（9公里，约38分钟）

◇ 上海火车站出发：地铁1号线，常熟路站下，站内步行200米，乘地铁7号线，到肇家浜路站下车（3号口出），步行391米到达。（8公里，约35分钟）

2. 北京站

--培训地点：

中国科学院微生物研究所   北京市朝阳区北辰西路1号院3号

--乘车路线：                                                                                                                                                                 

◇ 首都国际机场出发：步行660米，955路（岗山村站上，地铁国展站下，7站）步行300米，换乘地铁15号线（国展站上，奥利匹克公园站下，9站）步行960米 （29公里/约1小时40分钟）

◇ 南苑机场出发： 南苑机场大巴西客站，公主坟专线(南苑机场站上,宣武门站下,6站)，步行290米，换乘特13路（宣武门站上，南沟泥河站下，15站）步行660米 （28公里/约2小时）

◇ 北京站出发：地铁2号线(北京站上,雍和宫站下，5站)，步行160米，换地铁5号线(雍和宫站上，大屯东路站下，5站)，步行100米，换成913路（地铁大路东站上，中科院地理所站下，4站）步行280米 （16公里/约1小时）

◇ 北京南站出发：地铁4号线大兴线(北京南站上,平安里站下,7站)，步行130米，换乘特13路（平安里路口北上，南沟泥河站下，10站）步行660米 （18公里/约1小时）

◇ 北京西站出发：步行140米，地铁7号线（北京西站上，磁器口站下，9站），步行160米，换成地铁5号线（磁器口站上，大屯东站下，12站）步行100米，换成913路（地铁大路东站上，中科院地理所站下，4站）步行280米 （25公里/约1小时20分钟）

◇ 北京北站出发： 步行860米，地铁2号线(西直门上,鼓楼大街站下,2站)，步行330米，换地铁8号线(鼓楼大街站上，奥利匹克公园站下，5站)，下车步行960米 （12公里/约1小时）

3.    广州站

--培训地点：广州站的地址为广州科学城掬泉路3号广州国际企业孵化器C座3楼多媒体会议室

--乘车路线：

◇ 白云机场出发：地铁三号线北延段（机场南站上，体育西站下，12站），步行400米，换乘b4a路，（brt体育中心站上，科学大道站下，25站）步行290米 （50公里/约2小时10分钟）

◇ 广州站：步行540米，地铁5号线（广州火车站上，车陂南站下，12站），换成地铁四号线（车陂南站上，车陂站下，1站），步行800米，换乘b4a路（brt车陂站上，科学大道站下，15站）步行290米 （28公里/约1小时40分钟）

◇ 广州东站：东站汽车客运站乘坐508路（东站汽车客运站上，科学大道下，17站）（17.5公里/约1小时10分钟）

◇ 广州南站：地铁二号线（广州南站上，昌岗站下，8站），换乘地铁8号线（昌岗站上，客村站下，4站）。换乘地铁3号线（客村站上，岗顶站下，5站）步行140米，换乘b4a路（brt岗顶站上，科学大道下，23站），步行290米（40.6公里/约1小时50分钟）

住宿及周边酒店推荐：

1.  上海站

--指定酒店预定

上海好望角大饭店（★★★）

地址：上海市徐汇区肇嘉浜路500号

【备注】

1. 如需我们代为安排住宿，请将需预定的房型+房间数+住宿人数+入住与离店时期发送到

marketing@cloudscientific.com

2. 住宿费用均自理，到酒店入住时支付，离店由酒店开据住宿发票。

--周边推荐酒店

【备注】：组委会不提供会场周边其他酒店的预定，请您与酒店联系。

2.  北京站

--周边推荐酒店

【备注】：组委会不提供会场周边其他酒店的预定，请您与酒店联系。

3.  广州站

--指定酒店预定

华厦国际商务酒店（★★★★）

地址：广州黄埔区科学城揽月路1号，近国际网球中心

【备注】

1. 如需我们代为安排住宿，请将需预定的房型+房间数+住宿人数+入住与离店时期发送到

marketing@cloudscientific.com

2. 住宿费用均自理，到酒店入住时支付，离店由酒店开据住宿发票。

--周边推荐酒店

【备注】：组委会不提供会场周边其他酒店的预定，请您与酒店联系。