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非标记(Label-free)定量蛋白质组分析

参考报价: 面议 型号: 非标记(Label-free)定量蛋白质组分析
品牌: 集思慧远 产地: 南京
关注度: 34 信息完整度:
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产品简介

非标记定量技术(Label Free)用来比较的样品不经过任何标记,直接酶解后经过质谱分析产生数据。通过软件对谱图进行归一化后,比较对应的质谱峰的强度,峰面积等一系列因素,来确定蛋白质在几组样本中的相对表达量变化。它是一种不依赖于同位素标记的新型蛋白质定量技术,该技术通过液质联用对蛋白质酶解肽段进行分析,无需昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样本中相应肽段的信号强度,就能对相应的蛋白质进行相对定量。


  技术原理:

  非标记定量蛋白质组学已成为越来越重要的质谱定量方法,按照其原理主要分为两种:

  Spectrum counts类的非标记定量方法:发展比较早,已经形成多种定量算法,但主要原理都是以MS2的鉴定结果为定量基础,各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。

  另一种非标记定量方法的原理是以MS1为基础,计算每个肽段的信号强度在LC-MS色谱上的面积积分。


  应用领域:

  疾病标志物筛选

  作用机制研究

  药物作用靶点研究

  特殊功能蛋白质筛选

  植物抗逆研究

  疾病的分子分型


  产品优势:

  •不需要昂贵的标记

  直接根据一维色谱及一级质谱的峰面积进行蛋白定量,不需要同位素标记,实验耗费低

  •实验要求高

  对液相色谱分离及串联质谱鉴定的稳定性和重复性要求较高,需要有足够的技术重复以确证结果的可靠性

  •样品不受限制,无标记偏差

  与标记技术相比,非标记技术对于样品数量无限制,克服了标记定量技术在对多个样本进行定量和定性方面的缺陷,并且克服了标记定量技术对于某些不易标记的蛋白/肽段检测效果不好的缺陷


  技术路线:


内容分析

      分析内容:

  蛋白质组鉴定;

  Unique肽段数分布;

  肽段长度分布;

  肽段质量误差分布;

  蛋白覆盖度分布;

  定量信息统计;

  蛋白质丰度比(FC)分布;

  差异蛋白质的功能注释(两个或以上样品);

  差异蛋白质的GO和KEGG富集分析(两个或以上样品);

  差异蛋白质互作网络。


  样品要求:

  1.样品类型:总蛋白;

  2.样品总量:>500mg(新鲜组织样); >300ug-500ug(提取蛋白量)。

  3.样品重复:三个生物重复或技术重复

案例分析

案例分析:

  1、胚胎发育期间果蝇的黑腹果蝇蛋白质组学

  本研究以在产卵后每4.5小时收集果蝇胚胎(0-4.5小时,4.5-9小时,9-13.5小时, 18小时和18-22.5小时)进行蛋白质组研究。本研究为不同时期和不同方法下的差异蛋白质的鉴定提供了思路。


结合SWATH和DDA label-free定量在胚胎发育期间检测蛋白质组


  参考文献:

  1. Fabre B, Korona D, Groen A, et al. Analysis of Drosophila melanogaster proteome dynamics during embryonic development by a combination of label‐free proteomics approaches[J]. Proteomics, 2016, 16(15-16): 2068-2080.


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注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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