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16S/18S/ITS扩增子测序

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参考报价: 面议 型号: 16S/18S/ITS扩增子测序
品牌: 集思慧远 产地: 南京
关注度: 2 信息完整度:
样本: 暂无样本 典型用户: 暂无

产品简介

  微生物群落多样性分析是指利用二代高通量测序技术,对微生物的16S rDNA、18S rDNA、ITS以及目标区域扩增子测序,分析环境中细菌、古细菌以及真菌的种类组成和含量,揭示环境样品中微生物种类以及它们之间的差异、相对丰度、种群结构和进化关系;对于研究微生物与人类医疗健康、食品安全、环境检测与治理、微生物资源的利用等有着重要的指导作用。

内容分析        

     产品优势:

  1. 强大的实验测序平台,测序周期短且可靠

  2. 成熟的分析方法,专业的技术人员

  3.多方面的分析内容,为您的项目提供解决方案


  技术路线:

  分析内容:


  样品要求:

  1.样品类型:环境样品DNA;

  2.样品浓度:>10 ng/ul(Qbit 检测浓度);

  3.样品总量:≥500ng;

  4.样品纯度: OD260/280为1.8~2.2;

  5.电泳要求:主带清晰,无降解或轻度降解。

案例分析

1、16s rRNA揭示水稻根系微生物多样性

  本研究对不同地方和不同品种的水稻根部三个区间(根系与土壤接触的部分、根表皮、根根内部)的微生物的种类和丰度进行分析,扩增了样本DNA的16s rRNA的V4区域。研究结果表明:温室栽培条件下,根系微生物主要受土壤类型和品种影响;大田栽培条件下,地理位置、栽培条件以及品种影响微生物多样性,并且能够鉴定与甲烷相关的古细菌;进一步分析发现水稻根系表面微生物的分布类群与其他植物非常相似。这些研究结果为陆地植物的栽培提供了可靠依据。


根系微生物分析


  2、人类皮肤微生物多样性

  本文基于培养的方法研究了来自华盛顿的10位18-40周岁的健康人皮肤表面微生物分布情况。分别取每人14个不同身体部位的皮肤样本,每个样本根据实际情况取不同数量的生物学重复,对不同样本的16S V1-V3、18S SR6-SR1、ITS1 进行了测序,用以观察身体不同部位皮肤中细菌和真菌分布差异及其多样性,本文也利用 ITS1测序对同一人体样本间隔1-3月后身体不同部位皮肤中真菌多样性进行了研究。


细菌和真菌分布PCoA分析

  参考文献:

  1. Metagenome Sequencing of the Hadza Hunter-Gatherer Gut Microbiota (Cell Press, 2015, IF = 9.571)

  2. Topographic diversity of fungal and bacterial communities in human skin. (Nature, 2013, IF = 41.456)


注:该仪器未取得中华人民共和国医疗器械注册证,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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