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宏基因组测序

参考报价: 面议 型号: 宏基因组测序
品牌: 集思慧远 产地: 南京
关注度: 46 信息完整度:
样本: 典型用户: 暂无
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产品简介

宏基因组测序,是一种直接对某一特定环境中微生物基因组进行分析,通过构建宏基因组文库,利用基因组学的研究策略研究微生物群体基因组成及功能,解读微生物群体的多样性与丰度,是研究微生物功能多样性、开发新的生理活性物质等的一种新理念和新方法。对于研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源的利用有着重要的理论和现实意义。


  产品优势:

  专业的研究方案:对测序结果组装分析后,得到微生物群体基因组及功能、分析微生物群体中物种和基因的多样性和丰度,微生物菌落结构与宿主(或环境)之间的相互关系等

  更合理的研究方法:在分析过程中,采用一些更为准确的方法,从而得到更为可靠的分析结果

  新的分析方法:增加了MGS等宏基因组分析的方法,对样品中的信息得到更大的解析


  技术路线:

内容分析        

     分析内容:


  样品要求:

  1.样品类型:环境样品 DNA;

  2.样品浓度:≥50 ng/ul;

  3.样品总量:≥15ug;单次文库制备用量为5ug,为保证实验的顺利进行,因此需保证样品总量大于3次以上的建库用量;

  4.样品纯度:OD260/280为1.8~2.2;

  5.电泳要求:主带清晰,无降解或轻度降解。

案例分析

案例分析:

  1、宏基因组揭示人体肠道微生物多样性

  本研究利用宏基因组,对27位健康哈扎人和11位意大利人进行肠道微生物分析。结果表明,哈扎人肠道微生物中与氨基酸代谢和多糖代谢相关基因丰度较高,意大利人肠道微生物中与单糖(葡萄糖、蔗糖、果糖等)代谢、氨基酸代谢有关基因丰度较高;两者之间的差异可能与其饮食有关。此外,哈扎人肠道微生物中抗生素耐药性基因组成与土壤、水体来源的抗生素耐药性组成相似,而意大利人的抗生素耐药性则跟其生活环境和抗生素使用范围类似。人体肠道微生物的研究有助于了解其在人体生理机能方面的作用,同时阐明了人类生活和生存方式的多样性。



肠道微生物抗生素耐药性分析


  2、宏基因组学研究揭示肠道菌群之间的生命运动规律

  本研究收集了181个来自于中国人肠道菌群的样本,其中98个中国肝硬化患者的粪便样品及83个健康中国人志愿者的粪便样品,验证阶段收集31个健康人及25个肝硬化患者的MGS丰度。从中获得269万个非冗余的人体肠道微生物菌群的基因集,建立了肝病肠道菌群基因集,其中36.1%的基因是发现的。共有75,245个基因在肝硬化患者和健康人志愿者中呈现显着差异,可以归类到66个基因簇,该基因簇为肝硬化的生物标记物,其中在肝硬化患者中富集的是28个基因簇,健康志愿者中富集的是38个基因簇。通过对粪便微生物中15个基因的检测可以诊断肝硬化,同时找到的细菌标志物为肝硬化微生态制剂的研发也提供了方向。


病人(n=123)和健康人(n=114)个体肠道菌群中富集的不同丰度的MGS


  参考文献:

  1. Metagenome Sequencing of the Hadza Hunter-Gatherer Gut Microbiota (Cell Press, 2015, IF = 9.571)

  2. Alterations of the human gut microbiome in liver cirrhosis. ( Nature, 2014, IF = 41.456)


宏基因组测序信息由南京集思慧远生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于宏基因组测序报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

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