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知识集|基因家族之MYB

发布时间: 2019-10-17 22:01 来源:南京集思慧远生物科技有限公司

     大家好吖,之前我们的“短、平、快”明星产品-基因家族项目的客户们一连发了数篇具有代表性的文章,其余小伙伴们都恍然大悟,跃跃想要一试呐!!!小编也接到了好多小伙伴们的电话及私信,获得了很多反馈:找不到研究思路?现在开始做是否来得及?如何利用大公共数据发文章?小编今天就先从海量数据中给大家介绍一位转录因子,一起解读关于它的故事,来为大家后续研究做相关参考。


       MYB基因家族介绍MYB基因家族介绍 (v-myb avian myeloblastosis viral )是与调控植物生长发育、生理代谢、细胞的形态和模式建成等生理过程有关的一类转录因子,在植物中普遍存在,同时也是植物中最大的基因家族之一。


“我”的功能你别猜

       MYB 转录因子具有多种生物学功能,广泛参与植物根、茎、叶、花的生长发育,与此同时,MYB 基因家族对干旱、盐渍、冷害等非生物胁迫过程也有响应,此外 MYB 转录因子还与某些经济作物的品质好坏密切(例如鲜花色泽、果实颜色等)相关。


“我”的结构不一般

MYB 类转录因子的得名是因其结构上都有一段保守的 DNA 结合区,即 Myb 结构域。大多数 MYB 蛋白在 N 端含有一段氨基酸残基组成的 Myb 结构域,根据这个高度保守的结构域的结构特征可将 MYB 转录因子分为四个亚类:1R-MYB/MYB-related;R2R3-MYB;3R-MYB;4R-MYB (4个 R1/R2 的重复)。R 结构是由 50 个左右的氨基酸组成的折叠蛋白,包含一系列高度保守的氨基酸残基和间隔序列,其中氨基酸残基以螺旋 - 转角 - 螺旋(HTH)的形式参与到与 DNA 的结合过程,间隔序列则由一个色氨酸残基组成,每隔 18 个氨基酸会间隔着一个色氨酸残基,这个色氨酸起着疏水核心的作用,对维持 HTH 的构型具有重要意义。


“我”的亚类有四个

       根据 MYB 基因包含的 R 结构的个数可以将MYB 转录因子分为四个亚类:

       (1)只含一个 R 结构域的 MYB 转录因子亚类,即 1R-MYB/MYB-related,单一 R 结构的 MYB 蛋白可存在于肽链的两端或中间,该类蛋白是重要的端粒结合蛋白,其主要作用是集中维持染色体结构的完整性,但在调节基因转录过程也发挥一定的作用。

       (2)含有两个 R 结构域的 MYB 转录因子亚类,R2R3-MYB 蛋白是植物中数目最多的一类蛋白,它们在 N 端都含有两个 R 结构R2R3,一般在 C 端都具有转录激活功能,它们广泛地参与细胞分化、激素应答、次生代谢、环境胁迫以及抵抗病虫的侵害。

       (3)含有三个 R 结构域的 MYB 转录因子亚类,植物中的 R1R2R3-MYB 蛋白成员相对较少。现有研究表明:植物中的 3R-MYB 蛋白与真菌中的3R-MYB 蛋白高度同源,主要在调节细胞周期和细胞分化过程中发挥作用,同时,与植物对逆境的耐受性也有紧密联系。

       (4)含有四个 R 结构的 MYB 转录因子亚类,目前发现的 4R-MYB 数量较少,4 个 R 结构即为 4 个类似R1/R2 结构的重复,4R-MYB 蛋白只在极少数植物中进行编码,目前仅在拟南芥、杨树和葡萄发现了少数的 4R-MYB 基因,且该亚类与植物生理过程的相关性研究较少,所以关于这种蛋白的了解也较少。


       在植物进化过程中,MYB 蛋白的功能越来越多而呈现多样化, 转录因子对基因表达调控机制还远未阐明,剩下的未知就等着各位小伙伴们来深度挖掘研究啦,集思慧远愿助您一臂之力。


       【 文章追踪 】:牛义岭,姜秀明,许向阳.植物转录因子MYB基因家族的研究进展[J].分子植物育种,2016,14(8):2050-2059. DOI:10.13271/j.mpb.014.002050.


       基因家族文章,投入低、产出快的好选择,俗称“灌水小能手”。殊不知基因家族也是一种“稀缺资源”,一个物种上就那么多,鉴定完发一个就少一个,这种类型的文章引用率又很高,所以往往是“今天你爱答不理,明天就高攀不起”。如果您也想拥有一篇基因家族文章就要抓紧时间啦,集思慧远专业技术团队等您来询,期待与您的合作!

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