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- 大鼠11个器官和4个发育时期的转录组 发布时间：2019-03-18 21:52
- 摘要： 大鼠作为一个用于评价化学毒性和理解药物机制的模型，已被广泛使用。然而，它在各个器官或发育阶段的转录组尚未报道。本研究对11个器官和4个发育时期（幼年、青年、成年、老年）的320个样品进行RNA-seq。在AceView注释下，共得到40064个基因的表达谱，65167个转录本，31909个剪...... [全文]
- 斑马鱼尾鳍位置记忆的转录、蛋白质组学和代谢组学研究 发布时间：2019-03-18 21:42
- 位置记忆赋予再生组织两个关键属性。首先，离身体近端的截肢比远端截肢的再生更快。第二，新的组织是有图案的。只有损伤部位远端的结构才能再生。虽然相当多的研究集中在了解不同的生物体是如何开始再生的，并且计算模型已经预测了位置信息如何调节再生生长，然而关于位置记忆的细胞机制知之甚少。 跨膜受体Prod1是...... [全文]
- 砷暴露对小鼠肠道宏基因组和代谢谱的响应 发布时间：2019-03-18 19:18
- 背景：人类肠道是一个极其复杂、多样和庞大的微生物群落-肠道微生物群。肠道微生物群在代谢过程、能量产生、免疫和认知发育、上皮稳态等方面发挥着重要作用。然而，肠道微生物群的组成和多样性很容易受到外界因素的影响，这就增加了接触有毒环境化学物质导致肠道微生物群改变或失调的可能性。砷的暴露影响全世界的大量人...... [全文]
- 小鼠肠道微生物多样性+代谢组联合分析 发布时间：2019-03-08 21:50
- 摘要 低剂量的、不会杀死细胞的辐射处理会对病理学的临床表现造成强烈的影响，包括微生物和宿主基因表达的变化。尽管肠道微生物对维持人类身体健康的必要性已经广为人知，但是辐射对微生物群落的改变机理仍然了解的很少。本研究将小鼠暴露在高LET（线性能量传输）辐射下，观察肠道微生物组分和功能的潜在变化。同时发现...... [全文]
- 编码和非编码RNA与蛋白结合鉴定 发布时间：2019-03-08 19:14
- 摘要 全转录组范围内鉴定能与蛋白结合的RNA（RBPs），是了解转录后基因调控网络的必要条件。然而RBPs蛋白组的研究主要局限于多聚腺苷酸的RNA与蛋白的结合，对于没有ploy-A尾的RNA（主要的是非编码RNA和RNA前体）几乎都没发现。本文介绍了一种点击化学（主旨是通过小单元的拼接，来快速可靠地...... [全文]
- 综合转录-代谢组学分析揭示了收获草莓果实在短期内暴露于高浓度二氧化碳后的细胞反应 发布时间：2019-03-07 19:10
- 发表期刊：Postharvest Biology and Technology 影响因子：IF=3.112（SCI二区） 研究背景 草莓(Fragaria×ananassa Duch.)由于其独特的风味和多汁的质地，是一种在世界范围内广受欢迎的园...... [全文]
- 宏蛋白组揭秘健康人群肠道微生物的潜在及活跃功能 发布时间：2019-03-06 19:12
- 发表期刊：Microbiome 影响因子：9.133(SCI一区)研究背景 最近几年，对肠道微生物群(GM)的研究已经不仅仅是描述分类组成，通常是将16S rRNA基因测序应用于粪便样本，更广泛地研究GM的功能潜力，这是通过鸟枪法宏基因组学(MG)方法实现的。群体MG研究表明，尽管存在较大的个体间...... [全文]
- 全球油菜资源基因组重测序GWAS揭示不同生态型分化遗传基础 发布时间：2019-01-24 19:08
- 摘要：油菜是一种重要的油料作物，为了适应不同的气候带和纬度，形成了三种主要的生态型（冬性，半冬性，春性）。这些生态型多样性背后的遗传机制目前还是未知的。本研究这对收集的世界各地的991份资源品种进行全基因组重测序并分析了这些资源的遗传多样性。测序结果分别和油菜“Darmor-bzh”，“Tapido...... [全文]