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工商注册信息已核实!参考报价: | 面议 | 型号: | DRAGEN ™ |
品牌: | Illumina因美纳 | 产地: | 美国 |
关注度: | 暂无 | 信息完整度: | |
样本: | 典型用户: | 暂无 |
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经济高效的解决方案DRAGEN平台可以减少服务器集群的硬件投资和云计算资源的利用。本地DRAGEN平台可代替多达30个传统计算实例,从而降低了硬件和维护成本,以及电力消耗和冷却等其他费用。
BaseSpaceSequenceHub上的DRAGEN提供了同样高质量的DRAGEN流程,而且还具备BaseSpace的灵活性和安全性,平均价格为5美元/基因组和3美元/外显子组。*DRAGEN流程可以将read的比对结果本地压缩为CRAM文件格式,与标准BAM文件相比,能减少了50%的数据占用空间。
稳定可靠的应用程序DRAGEN平台具有一组稳定可靠的二级分析流程(表1),支持基因组、外显子组和RNA分析。能在流程的不同阶段接收输入文件或创建输出文件(图3),还能在单个本地服务器或BaseSpaceSequenceHub上运行多种不同流程。
图3∶DRAGEN流程的灵活性-根据DRAGEN流程功能的不同,每种流程都有一组独特的步骤。正如以上DRAGENermline Pipeline所示,DRAGEN可以灵活地接受多种输入文件格式并生成一系列输出文件,为用户提供个性化的体验并生成地们所需的文件格式。
定制参考基因组客户可以使用DRAGENReference Builder(也被称为哈希表)来生成非人类或非标准的参考基因组索引。创建的参考基因组索引可以用作所有DRAGEN应用程序的输入,这些应用程序都能支持客户的参考文件。DRAGENReferenceBullder需要FASTA文件。大多数DRAGEN流程都包含对hg19、hg38(包含或不含HLA)、GRCh37和Hs37d5的内置支持。
易于实施本地DRAGEN和BaseSpaceSequenceHub上的云端DRAGEN的解决方案适用于具备不同生物信息学专业知识水平的实验室——支持命令行执行和一键式执行(图4)。DRAGEN平台不需其他配置,可以直接使用。
一键式选项;BaseSpaceSequenceHub上的DRAGEN可让具备不同信息学专业知识水平的实验室都能以低廉的成本在内部进行二级分析。
命令行选项:本地DRAGEN提供了命令行界面,能通过基于简单易学的Linux的命令行界面(CLI)进行单命令启动或用于高级命令行。
图4:DRAGEN的实施选项-在BaseSpaceSequenceHub中,用户只需选择应用程序、输入信息并启动运行。本地DRAGEN采用的是命令行界面。新用户可选择易于学习和操作的命令行界面。更有经验的用户可以使用高级命令行界面进行自定义设置。*HIPAA兼容性仅适用于美国的企业级BaseSpace客户。
可扩展性DRAGEN平台能让实验室在保持低成本和短周转时间的同时实现规模化运行。DRAGEN可以通过多种方式来扩展研究能力:
1)满足NovaSeqTM6000系统的需求:一台DRAGEN服务器可以处理两台NovaSeq6000仪器采用双S4流动槽满负荷运行产出的数据。
2)可扩展容量:在高运算需求且样本量增加的情况下,实验室可以使用BaseSpaceSequenceHub上的DRAGEN来扩展计算能力。并行的DRAGEN流程可以让您将分析转移到BaseSpaceSequenceHub。
3)扩大运行规模:单个DRAGEN平台就可运行所有的DRAGEN流程和支持的样本类型。DRAGEN的速度、准确性和成本效益使用户可以扩大运行规模,而不会影响周转时间或结果的质量。
4)从外显子组到基因组:从全外显子测序(WES)扩大到全基因组测序(WGS)涉及到生成数据量的大幅度增长。DRAGEN能让客户轻松地从外显子组扩展到基因组,而且无需在额外的硬件基础设施或云端解决方案上进行大量投资。
可在本地或通过BaseSpaceSequenceHub使用稳定可靠的DRAGEN流程既可以在本地使用,也可以通过BaseSpaceSequenceHub在云端使用,让实验室能使用最符合其需求的解决方案。
本地DRAGEN对于希望在本地进行分析的机构,本地DRAGEN提供了稳定可靠的二级分析解决方案,可整合到现有的储存解决方案中(图5)。本地DRAGEN非常适合用于:
-将数据保存在本地:对于希望将数据储存在本地的机构,本地DRAGEN是一个理想的解决方案
Illumina Bio-IT 平台DNA测序仪DRAGEN ™信息由Illumina因美纳(中国)科学器材有限公司为您提供,如您想了解更多关于Illumina Bio-IT 平台DNA测序仪DRAGEN ™报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。
注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途