ATAC-seq

ATAC-seq（Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing） 是一种研究染色质可及性的分子生物学方法，这种方法的目的是鉴定DNA的可触及区域，即未被组蛋白捕获的开放区域。在基因组上，有很多开放的染色质区域，是转录因子和转录元件的重要结合位点。ATAC-seq，仅需要很少的细胞就能鉴定基因组中所有活跃的调控序列。该技术利用T5转座酶，将测序的adaptor插入这些开放的转录因子结合区域，以优先标记和检测核小体之间的DNA序列，从而可以获得转录因子结合位点等关键信息（下图）。

ATAC-Seq由于所需细胞量少，实验简单，可以在全基因组范围内检测染色质的开放状态，目前已经成为研究染色质开放性的首选技术方法。

1. 样本起始量低，ATAC-seq只需50000个细胞即可开展。

2. 灵敏度高，可覆盖全基因组范围内各种大小范围的开放区域。

3. 周期短，实验流程更快速，有利于加快研究速度。

基因组测序深度累积分布图

基因及上下游测序深度分布图

peak基因功能元件分布图

peak相关基因的GO/KEGG富集分析

peak及上下游reads表达水平热图

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