上海鹿明生物科技有限公司

400-6699-1171000

分析测试百科网 认证会员,请放心拨打!

热门搜索:
首页 > 产品展示 > 代谢组  > GC-MS全代谢组 GC-MS Metabonomics

GC-MS全代谢组 GC-MS Metabonomics

分享:
咨询留言
黄金会员

诚信认证:

工商注册信息已核实!

扫一扫即可访问手机版展台

参考报价: 面议 型号: GC-MS全代谢组 GC-MS Metabonomics
品牌: 鹿明生物 产地: 上海
关注度: 36 信息完整度:
样本: 暂无样本 典型用户: 暂无

GC-MS全代谢组

GC-MS Metabonomics

全代谢组又称非靶向代谢组(Untargeted metabolomics),对样本进行全面的、无侧重的检测,通过比较实验组和对照组样本,找出差异代谢产物,结合生物信息分析,找出富集差异通路,整合代谢网络。全代谢组旨在提供一个全面的研究视角来比较差异,通常用于标志物的筛选、分子机制研究及多组学整合分析。


GC-MS全代谢组学

 

技术的优点

 

不同的处理方法:1、采用衍生化方案,适合检测极性较强的小分子代谢物;2、采用非衍生化方案,适合检测沸点较低的小分子代谢物;3、采用固相微萃取-顶空进样方案,适合检测易挥发的香味或风味物质。

 

实验流程

000.png

分析内容 

001.png

送样要求

002.png

 注:顶空进样的样本最少2g

 

仪器设备

1587206376590165.jpg

 

小鹿智囊

1、代谢组研究相对于基因组和蛋白质组研究而言有什么不同之处?

主要特点包括三方面:一、基因和蛋白表达的有效的微小变化会在代谢物上得到放大,从而使检测更容易;二、代谢组学的技术不需建立全基因组测序及大量表达序列数据库;三、因为代谢产物在各个生物体系中都是类似的,所以代谢组学研究中采用的技术更通用。


2、代谢组的样品重复性有什么要求? 

代谢组学基于多元统计分析方法进行的,在样品准备上相对于转录组和蛋白质组而言需要更多的重复数据。一般建议植物样品:最少6次,建议8次生物学重复;

模式动物及微生物样品:最少8次,建议10次生物学重复;

临床样品:30次生物学重复以上,如组织样品不好取样,可控制在20次重复以上。


3、靶向代谢检测平台的选择?

GC-MS和LC-MS两种平台各有优势,主要是由目标化合物的理化性质决定,GC-MS适合易挥发性、分子量不太大的化合物,而且,离子源为EI,碎片信息多,有成熟的图谱库,便于化合物检索,对于非挥发性成分则需要衍生化;而LC-MS离子源为APCI或者ESI源,适合做中等或强极性的化合物,分子量范围广,灵敏度高,前处理简单,但是LC-MS的价格要贵点,因此可以根据实际情况选择合适的检测平台。


4、关于代谢组数据库问题,老师经常问起数据库是商业库还是自己建的库,类型?

GC-MS数据库:Nist、feihn;

LC-MS数据库:HMDB、Metlin、自建库(大连化物所-许国旺组)。

实例分析

颗粒物暴露与应激激素水平:随机、双盲、空气净化交叉试验


基本信息
        材料:人血清                                                 主要技术:GC-MS、LC-MS全代谢组
        期刊:Circulation.                                          影响因子:19.309

 

文章摘要
        暴露于环境颗粒物(PM)会造成不良的健康后果,但其潜在机制未知。代谢组学作为一个强有力的研究方法,特别在环境对生命体全代谢组变化影响的研究领域。文章因此对暴露于不同PM程度的大学生血清代谢物的变化进行了代谢组学研究。研究显示PM2.5为24.3gu/m3和53.1ug/m3的两种状态下,后者受试者的血清中皮质醇,肾上腺皮质酮,肾上腺素,降肾上腺素显著上升,同时葡萄糖,氨基酸,脂肪酸,脂质的成分都有不同程度的变化。此外,研究也发现PM会造成高血压,激素紊乱,胰岛素抵抗等现象。研究为PM的危害提供了更直接的研究数据,为相应的诊断提供了潜在的候选标志物。

 

实验流程

004.jpg

 

结果分析

1、多元统计分析

 005.jpg

2、差异代谢物筛选

006.jpg

3、差异代谢物表达

007.jpg

4、高血压与PMs相关性分析

008.jpg

   激素分泌与PMs相关性分析

009.jpg

5、PM诱发分子机制

010.jpg


小鹿推荐
        文章研究内容非常贴切现实生活也关系民生。采用测试对象均为本土(上海)大学生,PM为本土(复旦大学)环境,研究结果对中国大城市的年轻人意义深远,也是首次从代谢组学角度研究PMs的案例。文章采用双盲,随机设计,同时结合GCMS代谢检测平台和UPLC-MS检测平台,血清代谢物的检测覆盖度得到保障,后续大数据的统计分析采用OPLS-DA,直观明确。通过数据挖掘,文章找出了PMs引发亚健康的分子机制,也发现与高血压等相关症状的分子标志物,整体研究非常完整。


文献来源

 Huichu Li, et al., Particulate Matter Exposure and Stress Hormone Levels A Randomized, Double-Blind, Crossover Trial of Air Purifcation. 2017, Circulation.

GC-MS全代谢组 GC-MS Metabonomics信息由上海鹿明生物科技有限公司为您提供,如您想了解更多关于GC-MS全代谢组 GC-MS Metabonomics报价、型号、参数等信息,欢迎来电或留言咨询。

注:该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案,不可用于临床诊断或治疗等相关用途

GC-MS全代谢组 GC-MS Metabonomics - 产品新闻

移动版: 资讯 Webinar 仪器谱

Copyright ©2007-2021 ANTPEDIA, All Rights Reserved

京ICP备07018254号 京公网安备1101085018 电信与信息服务业务经营许可证:京ICP证110310号