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收官 | 鹿明生物第33期代谢组学培训顺利结业

发布时间: 2019-10-10 15:09 来源:上海鹿明生物科技有限公司

鹿明生物2019年第33期代谢组学培训班

 

微风轻拂、秋高气爽。上海鹿明生物科技有限公司第33期代谢组学培训班2019年9月26日上海鹿明生物会务中心顺利召开。本次培训班不仅诚挚邀请了在代谢组学方面的专家陈世礼博士的讲解,还吸引了各大院校、科研单位的研究者共同聚焦组学相关理论及应用。其中着重对于代谢组学LC-MS/GC-MS在代谢组学中的应用,样本的前处理以及靶向代谢组学方法开发以及方法学验证的讲解。同时,在生信分析方面,针对下机数据做预处理和数据的可视化和差异代谢物的筛选代谢通路富集,R语言作为重点方向。为各位老师和科研工作者提供更多的文章思路选择和探索。作为一直在科研路上的鹿明生物也将在代谢组学的研究中更加精进和深入。

 

一、培训班风采

   

Day1  9.26

 

9月26号微风轻拂、秋高气爽、清晨早起、寻班而坐。鹿明生物的代谢组学培训班是在鹿明生物CEO舒烈波博士的风趣欢迎致辞及知识小窍门get中开始的。在本次代谢组学培训班中,鹿明生物也更是希望前来的老师能够在这里收获知识、收获启发、更能够收获来自于鹿明生物这个大家庭的温暖及友谊。同时,对于鹿明生物能运用自身的优势,利用多组学研究给与各位老师在科研上的帮助,为科研事业和各位老师的课题研究做出自己的一点贡献也是鹿明生物一直在做的事情。

图1 | 鹿明生物CEO舒烈波博士致欢迎词

 

LC-MS/GC-MS在代谢组学中的应用 

此门课由上海交通大学医学院附属新华医院质谱与代谢组学实验室负责人陈世礼博士的讲解,在本次课程中,主要基于色谱-质谱的代谢组学技术的特点、技术基础、常用检测技术的讲解。通过对代谢组学的基础讲解相信很多老师可能觉得有些许难度,没错~~本次的代谢组学是朝向进阶班冲刺的,由基本到如何更好的获得代谢组学信息、熟悉代谢组学数据表现形式,只是为了老师能够更好的从自身的应用领域出发来设计自己的代谢组学研究思路

相信与大咖对话过的老师,也GET到了以前没有关注的点,学习后有新的发现,发现产生新的成效。相信这就是学习带给我们的价值,鹿明生物也是乐于在这种价值传递中奉献着对于科研的热忱。

讲师风采

     

图2 | 陈世礼博士讲解风采

 

LC-MS仪器介绍

重点来了,由鹿明生物高级质谱应用工程师英俊老师的精彩课堂。无论是仪器的选择应用还是仪器的科研实用性知识,相信听完英俊老师的课后,大家对于每种仪器适用于的方向和范围已经有了深刻的认识。当然,我们的英俊老师对于这门课的用心和准备也是相当的充分的,也让老师能够更全面具体的了解~~

图3 | 英俊老师讲解风采

 

实验室参观及介绍

上午的课程快要接近尾声的时候,英俊老师带我们参观了实验室,所谓说的不如看的,在看完实验室中整齐排列的仪器,对于LC-MS/GC-MS老师也能更加清楚和理解。

图4 | 参观实验室

 

样本前处理及基于LC-MS靶向代谢组学方法开发及方法学验证

样本处理的讲解由鹿明生物高级技术员玉玉老师讲解的,我们知道一个好的研究先从取样开始,在取样方面也是鹿明生物十分重视的环节,本次课程更是对于样本的细分和升华,从分类到制备方法、从前处理方法到不同方法的优劣势分析,逐层递进的告诉我们一件事,取样到前处理的阶段的关键性。相信玉玉老师的讲解和解答给了许多老师新启示~~

图4 | 玉玉老师讲解风采

 

下午稍作休息过后今天还有一门主打课,LC-MS靶向代谢组学方法开发及验证。在英俊老师的解说下,对于如何进行LC-MS分析、如何定性数据处理、如何进行数据的筛选及验证,英俊老师的精辟内容和使用解说,也让各位老师的求知欲爆棚。提问讨论,简直是应接不暇,我们英俊老师也从各方面、各角度地来解答,小编看到这场景觉得学习的真谛在于传播,传播有用有效的知识,才会有满满的幸福感。

 

图5 | 英俊老师讲课风采

 

图6 | 刻苦学习的同学

 

 

Day2 9.27

 

LC-MS下机数据预处理及多元统计分析

 第二天的课程主要围绕生信分析上机开展课程来自鹿明生物的Garvey老师针对下机数据如何处理,及多元统计分析进行了知识分享和手把手的实际操作。相信Garvey老师给大家带来了不少干货,PCA原理讲解、SIMCA多元统计实操、 R语言画图基础介绍,学会绘画常用图如:火山图,热图,相关性图等,并了解每种图特性和作用。课程结束后学员们也是纷纷提问,Garvey老师也是在各个方面详尽解答,从提问的热情来看,想必学员们也是收获多多,回去也是迫不及待的针对自己的课题上手数据啦~~

课堂风采

    

图7 | Garvey老师课堂风采

 

数据可视化及差异代谢物的筛选及代谢通路富集

 在可视化数据方面,鹿明生物也是我们所能帮助老师能独立完成筛选差异代谢物,,掌握差异筛选的方法。在代谢通路富集方向,重点的内容差异代谢物kegg的转换,通路富集及kegg相关信息查看的知识的学习。相信很多老师已经get到了技能。

图8 | 老师讲课风采

 

当然,茶歇的美味甜点也是少不了的...

 

图9 | 美味小零食

 

 

 

 

热烈讨论

图10 | 课间的热烈讨论

 

最后,相信老师在鹿明生物这次的学习,能够收获知识、收获成就、收获感动,更多的是能够感受到鹿明生物这个大家庭的温暖~~

 

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关于鹿明

上海鹿明生物科技有限公司,一直专注于生命科学和生命技术领域,是国内早期开展以蛋白组和代谢组为基础的多层组学整合实验与分析的团队。经过近数年的发展沉淀,公司建立起了iTRAQ/TMT、DIA、PRM、修饰蛋白组等蛋白组学技术平台和全谱代谢组、靶向代谢组、拟靶向代谢组、脂质组等代谢组学技术平台以及相应的数据整合分析平台,并建立了科学完整的服务流程和精细规范的操作标准。

公司拥有:

SCIEX-QTRAP-6500,

SCIEX-QTRAP-4000,

Waters Xevo G2-XS,

Thermo-TSQ-Altis,

Thermo-Obritrap-QE,

Thermo-Obritrap-QE-HF,

Aglient-GCMS-7890B/5977A,

AglientGCMS7890B/5977A(带顶空进样装置)

及云计算分析平台等大型检测设备以及完整的样品前处理系统和数据分析系统(拥有各类分析软件及数据库)。

 


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