代谢组学 | 基于GC-MS的Bt-转基因和野生型水稻在杀虫剂处理下的叶片代谢组转变

上期我们已经推出一篇蛋白组学iTRAQ技术方面的论文啦，论文受到广大老师们的喜爱并纷纷要求原文啊，话不多说，今天小鹿给各位看官推出的精选论文是关于代谢组学的GC-MS技术相关论文哦，跟随小鹿一起来走进知识的海洋吧

1基本信息

材料：水稻叶片

期刊：J. Proteome Res.  

主要技术：GC-MS代谢组

影响因子：4.245

2文章摘要

杀虫剂通常用来防治害虫，而其对植物的潜在影响还鲜有报道。本文通过GC-MS对野生型和Bt转基因型水稻在经杀虫剂处理后的时程代谢改变情况进行分析。通过双因素方差分析和多因素分析(主成分分析和分层聚类分析)的整合分析找到应激相关的影响因素。结果表明，在杀虫剂处理下，这两个品种中大量代谢物呈现动态变化，且氨基酸、糖类及脂肪酸的生物合成和代谢，TCA循环和莽草酸/苯丙通路等多个代谢途径与曝光时间和品种相关。一系列包括植物激素信号传导途径，抗氧化剂防御系统，莽草酸介导的次级代谢途径等等应激防御通路被激活。杀虫剂处理会导致Bt转基因水稻早期阶段的多种信号分子(水杨酸和茉莉酸的前体)和抗氧化剂(α生育酚和脱氢/抗坏血酸)呈现更强烈的反应。本研究结果表明，Bt转基因水稻比野生型水稻在抗氧化系统和信号调节方面有更加激烈的反应。

3方法流程

4小鹿点评

本文代谢物的提取采用的Fiehn Lab开发的针对植物代谢物提取的标准方法，值得学习。通过基于GC-MS的代谢组学分析动态地展现了BT-转基因水稻和野生型水稻的时程代谢情况，使得读者对应激反应过程中主要代谢物的动态变化过程可以清晰的把握，这也是本文的亮点之一。最后，本研究还结合了多种数据处理方法筛选了应激相关代谢物，使得结果更准确可靠。
 

5文献来源

 Zhou J. et al., Alteration of leaf metabolism in Bt-transgenic rice (Oryza sativa L.) and its wild type under insecticide stress. 2012, J. Proteome Res.