代谢组学相关--植物脂质组

1. 产品简介

　　脂质是一类难溶于水而易溶于非极性溶剂的生物有机分子。其主要包括以下八大类 (LIPID MAPS系统命名)：脂肪酸类（如亚油酸、花生酸类）、甘油脂类（如TG、DG类）、甘油磷脂类（如PC、PE、PG、PA等）、鞘脂类（如Cer、SM等）、固醇脂类（如固醇脂类）、糖脂类（如MGDG、SQDG等）、孕烯醇酮脂类（如CoA等）、多聚乙烯类。

脂质组服务内容

　　2. 应用领域

　　◆ 生物胁迫的研究

　　◆ 非生物胁迫的研究

　　◆ 生长发育的研究

　　◆ 作物营养品质的研究

　　3. 技术路线

　　37种脂肪酸和游离脂肪酸由于物质过少，只提供定量结果。

　　4. 样品要求

　　1.样品类型　　a. 细胞，取样后离心，去除培养基，立即放入液氮中，之后-80°保存；
       b. 叶片、茎、花等，取下后立即放入液氮中，之后-80°保存；
       c. 果实的果肉、果皮等，如果野外现场不具备分离条件，需尽快（30 min内）转移至室内，分离样品放入液氮中，之后-80°保存。

　　2.混合取样

　　每份样品混合来自至少3株以上的组织。以水稻叶片为例：取同一时期，表型基本一致的同一个部位的1片叶片，同时取6株，放到钻孔的10ml离心管中，并迅速放入液氮中。

　　3.样品重量和重复

　　新鲜的、干净的植物样品，样本建议量≥200mg，准备3份及以上生物学重复。

　　4.储存和运输

　　干冰运输（以3-4公斤干冰挥发一天计算，请使用足量的干冰运输）。

　　b.叶片、茎、花等，取下后立即放入液氮中，之后-80°保存;

　　c.果实的果肉、果皮等，如果野外现场不具备分离条件，需尽快(30 min内)转移至室内，分离样品放入液氮中，之后-80°保存。

　　5. 文章案例

　　标题：AKR2A通过调节长链脂肪酸的生物合成参与棉纤维发育的调控

       方案设计：
       1.构建AKR2A过表达载体，并将其用于转化陆地棉品种Coker312，对其表型观察。
       2.使用气相色谱质谱分析法测量15 DPA和成熟纤维的内源性VLCFA含量。
       3.选取发育15DPA和成熟的纤维组织进行转录组检测，并qRT-PCR验证。
       4.ACS、ACC、IAA和H2O2含量的测定。

       结果分析：
       1.AKR2A过表达促进棉纤维伸长，提高棉纤维长度。
       2.在AKR2A转基因株系中，VLCFA含量和VLCFA与短链脂肪酸的比率增加。
       3.AKR2A通过调节乙烯并与植物生长素和过氧化氢的积累协同作用来促进纤维伸长。
       4.AKR2A上调参与VLCFAs生物合成，乙烯生物合成，生长素和过氧化氢信号，细胞壁和细胞骨架组织的基因的转录水平。
       5.AKR2A与KCS1相互作用，调节拟南芥VLCFA的生物合成。

       参考文献
Wenjun Hu, Lin Chen, Xiaoyun Qiu,et al.AKR2A participates in the regulation of cotton fifibre  development by modulating biosynthesis of very long-chain fatty acids . Plant Biotechnology Journal, 2019.

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