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代谢组学相关--植物次生代谢组

参考报价: 面议 型号: 植物次生代谢组
品牌: 迈维代谢 产地: 武汉
关注度: 602 信息完整度:
样本: 典型用户: 暂无
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AI问答
可以做哪些实验,检测什么? 可以用哪些耗材和试剂?

1.产品简介:

  次生代谢物是植物生命活动十分重要的物质,与植物防御病虫害及应对环境胁迫密切相关。基于广泛靶向代谢组技术,迈维建立了包括3500多种次生代谢物的数据库,助力于植物次生代谢组学研究。

  应用方向:

  ◆ 植物次生代谢物成分鉴定

  ◆ 植物次生代谢物通路研究

  ◆ 植物抗病虫害研究

  ◆ 药用植物活性成分鉴定

  ◆ 植物药用功能与作用机制研究

 

  2.技术路线:

 

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  技术优势:

  ◆ 数据库大:包含3500多种物质,TCM领域最大数据库

  ◆ 数据库全: 60科400多个物种构成,覆盖常见物种

  ◆ 物质种类多:包括萜类400多种,生物碱800多种,香豆素180多种,甾体200多种… …

  ◆ 定性准确:自主研发二级谱匹配方法,项目样本物质二级谱与公司数据库二级谱逐一智能匹配

  ◆ 定量准确:三重四级杆MRM模式,定量黄金标准,准确检测物质相对含量

 

  3.样品要求:

  1.取样建议

  a. 叶片、茎、花等组织,取下后立即放入液氮中速冻2min以上,然后转移到-80℃保存,避免反复冻融。较大叶片需要用剪刀快速剪碎。

  b. 地下组织(根、块茎等),将分离出的样本快速用灭菌水清洗,吸水纸吸走多余的水分后,立即放入液氮中速冻2min以上,然后转移到-80℃保存。块根等组织,需要切成 1-2cm 大小块状。

  c. 果肉、果皮组织,如果野外现场不具备分离条件,需尽快(30min内)转移至室内,低温条件下将分离果皮或果肉切成 1-2cm 块状,立即放入液氮中速冻2min以上,然后转移到-80℃保存。

  d. 细胞样本,取样后离心去除培养基,立即放入液氮中速冻2min以上,转移到-80℃保存。

  2.混合取样

  取样时为了保证样品的准确性和减少系统误差,每份样品选取 3 株以上长势一致的材料混样。以水稻叶片为例:取同一时期,表型基本一致的同一部位1片叶片,同时取6株,放入10ml离心管中,迅速放入液氮中。

  3.样品量与生物学重复

  a.每份样品取鲜样不低于3g,干样不低于1g,细胞样品细胞量不低于107。

  b.每组至少3个生物学重复,准备备份。

  4.储存与运输

  -80℃保存,足量干冰运输,避免反复冻融,干冰建议用量 5kg/天(根据样本运输需要时间计算)。

 

  4.案例分析

  案例分析:桃儿七中鬼臼毒素合成通路的代谢及转录分析

  鬼臼毒素是是抗肿瘤药物依托泊苷的前体,但其生物合成途径中只有一部分是已知的。作者利用转录组和代谢组技术,对鬼臼毒素途径中的生物合成基因进行了鉴定。选择了29个候选基因在烟草中组合表达,并鉴定了6种途径酶。通过在烟草中共表达10个基因,重建了(-)-4'-desmethylepipodophyllotoxin的途径,这是一种天然产生的木脂素,是依托泊苷的直接前体,与鬼臼毒素不同的是,它是一种有效的拓扑异构酶抑制因子。最终,作者完成了鬼臼毒素完整的合成通路,并且实现了体外烟草中鬼臼毒素的合成。

 

 

桃儿七中鬼臼素的生物合成途径

  5.参考文献:

  Lau W, Sattely ES.Six enzymes from mayapple that complete the biosynthetic pathway to the etoposide aglycone.Science. 2015,349(6253):1224-1228.


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