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大爆发!平均IF>10 | 项目文章(大湾区)遍地开花

发布时间: 2022-03-28 17:00 来源:武汉迈特维尔生物科技有限公司

Tips


迈维代谢公众号【二维码见文末】后台发送“大湾区项目文章”即可获取9篇文献原文。

前言

本周给大家带来大湾区(华南区)的9篇项目文章解读。


第一篇文章新冠患者肠道微生物功能受损的后遗症研究,研究发现COVID-19在疾病缓解前后的肠道微生物功能发生紊乱,包括短链脂肪酸和L-异亮氨酸生物合成减少。补充短链脂肪酸或L-异亮氨酸的策略可能会改善疾病的结局。第二篇文章报道了新冠患者糖脂代谢失调机制,发现胰岛素抵抗是covid-19患者高血糖背后的主要病理生理机制。第三篇文章运用多组学及新的算法解析了新冠肺炎儿童的分子变化第四篇是首个基于中国汉族人群的冠心病mGWAS研究,鉴定了7个新的代谢物数量性状基因位点(mQTLs)并揭示了这些mQTLs可能的临床意义。第五篇文章通过大队列脂质组发现了冠心病患者新型预后标志物,构建了包含10种脂质和两种传统生物标志物的新型预测模型,用于预测5年死亡风险。第六篇文章使用二甲双胍干预肥胖小鼠,表明二甲双胍改善肥胖小鼠的肠道微生物群组成,并改善肥胖小鼠的学习和记忆功能。第七篇文章利用代谢组学来筛选白藜芦醇干预后小鼠的代谢途径变化,发现口服白藜芦醇显著改善了小鼠后肢缺血,这些作用与嘧啶代谢、嘌呤代谢以及丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢途径高度相关。第八篇文章比较了两种胆汁淤积模型,发现多次皮下注射α-萘基异硫氰酸酯 (ANIT) 引起的肝内胆汁淤积会导致更严重的肝纤维化、肠屏障损伤、肠氧化、炎症损伤。第九篇文章用六君子汤(LJZD)治疗顺铂引起的厌食症,首次结合网络药理学和代谢组学方法来研究 LJZD 疗效的潜在机制。


文章一


新冠患者肠道微生物功能受损的后遗症研究


 ● 发表单位香港中文大学医学院

 ● 期刊:Gastroenterology

 ● 影响因子:22.682

 ● 发表时间:2021.10.20


20211020日,香港中文大学医学院、肠道菌群研究中心黄秀娟(NGSiewChien)课题组张芬和万亚婷(共同一作),在GastroenterologyIF22.682)期刊发表了题为“ProlongedImpairmentof Short-Chain Fatty Acid andL-IsoleucineBiosynthesis in GutMicrobiome inPatientsWithCOVID-19的研究论文。该研究发现COVID-19在疾病缓解前后的肠道微生物功能发生紊乱,包括短链脂肪酸和L-异亮氨酸生物合成减少。补充短链脂肪酸或L-异亮氨酸的策略可能会改善疾病的结局。迈维代谢为该研究提供了基于GC-MS靶向短链脂肪酸检测和LC-MS靶向L-异亮氨酸检测分析的技术支持。



由严重急性呼吸综合征冠状病毒2型(SARS-CoV-2)感染引起的冠状病毒病2019(COVID-19)与肠道微生物组成改变有关。在SARS-CoV-2感染患者中,参与短链脂肪酸(SCFAs)代谢的肠道细菌的系统发育群减少。作者的目的是描述COVID-19患者在疾病治疗之前和之后肠道微生物群的功能特征。


在本研究中,作者前瞻性招募了66名使用抗生素治疗的COVID-19患者,并对他们从入院到出院后30天进行随访。利用宏基因组分析,对与疾病严重程度和免疫反应相关的肠道微生物群功能的改变和纵向动力学进行了表征。采用靶向代谢组学分析来检测粪便微生物代谢产物的变化进一步验证。


新发现COVID-19患者的肠道微生物群中短链脂肪酸(SCFA)和L-异亮氨酸生物合成能力受损,康复后持续存在,并与疾病严重程度和宿主免疫反应相关。


局限性这是一项观察性研究,没有明确的因果关系。肠道微生物组功能的这些变化是否会直接影响COVID-19的严重程度,还需要进一步研究。


影响这些发现表明COVID-19在疾病缓解前后的肠道微生物功能发生紊乱,包括短链脂肪酸和L-异亮氨酸生物合成减少。补充短链脂肪酸或L-异亮氨酸的策略可能会改善疾病的结局。


文章二


新冠患者糖脂代谢失调机制


 ● 发表单位广州市第八人民医院

 ● 期刊:Signal Transduction and Targeted Therapy

 ● 影响因子:18.187

 ● 发表时间:2021.12.16


广州市第八人民医院在“SignalTransduction and Targeted Therapy”(STTT)期刊发表了关于新冠患者糖脂代谢失调机制的最新研究成果(COVID-19induces new-onset insulin resistance and lipid metabolicdysregulation via regulation of secreted metabolicfactors)。迈维代谢作为共同作者之一,在此次研究中承担了血清脂质组和短链脂肪酸的检测和分析内容


研究背景

2019年至今,新冠(covid-19)已在全球传播,导致确诊病例2.5亿例,截至2021年11月10日,死亡人数上升到50万例(https://covid19.who.int/).这一流行病压倒性地阻碍了世界范围内的社会经济条件和医疗保健服务。covid-19患者的预后较差通常与基础疾病相关,包括糖尿病、肥胖、高血压和心血管疾病等。


已经有一些病例报告和观察性研究报道了covid-19患者的糖脂代谢异常,其潜在机制尚不清楚。一种潜在的假设,即covid-19可能导致胰岛素抵抗,从而导致高血糖。因此,胰岛素缺乏或胰岛素抵抗导致covid-19高血糖的进展仍存在高度争议,需要更多的临床数据和机制研究。


这项研究报道了胰岛素抵抗是covid-19患者高血糖背后的主要病理生理机制,并进一步阐明了其潜在机制,对covid-19患者代谢并发症的临床治疗和随访研究具有重要意义。



研究思路

共对124例covid-19患者(32例患有代谢相关疾病,92例无代谢相关疾病)和30例健康对照组进行了进一步研究。在92例无代谢相关疾病的covid-19患者中,非重症患者80例,重症患者12例,平均年龄为44岁。




研究结论

在本研究中观察到covid-19患者的新发胰岛素抵抗、血糖升高以及HDL-C降低,即使在病毒消除后,这种情况仍然存在。

在机制上,发现SARS-CoV-2感染诱导了REST的表达,REST转录调节MPO、apelin和肌生长抑制素的基因表达,导致糖脂代谢失调。


此外,这项研究的数据显示,(±)5-HETE、(±)12-HETE、丙酸和异丁酸可能是covid-19相关代谢失调的潜在生物标志物。



文章三


多组学及新算法解析新冠肺炎儿童的分子变化


 ● 发表单位广州市妇女儿童医疗中心、中科院武汉病毒所

 ● 期刊:Theranostics

 ● 影响因子:11.556

 ● 发表时间:2021.07


目前新冠病毒仍在全球肆虐,而中国在政府的积极应对下,彻底的扫清了国内的病毒传播。但是要彻底阻断全球疫情,依然任重道远。作为科研公司,迈维积极为国内科研工作者提供专业完善的服务,为抗击疫情做出自己的贡献。


2021年7月,迈维代谢为广州市妇女儿童医疗中心和中科院武汉病毒所的关于新冠感染儿童的项目提供蛋白组和代谢组服务,相关文章发表在Theranostics期刊上。



与新冠肺炎成人相比,参与凝血级联反应的血浆蛋白在新冠肺炎儿童中的表达明显更高,这表明新冠肺炎儿童中新冠肺炎相关的凝血和伴随的免疫反应/炎症可能非常活跃。另一方面,与新冠肺炎成年人相比,新冠肺炎儿童炎症和氧化的许多负性调节因子,如MMA、色氨酸、吲哚乙酸、二羟色胺、甘露醇和尿酸的水平也显著上调,表明存在拮抗作用。


因此,新冠肺炎儿童的免疫系统处于相对平衡的状态,其激活比新冠肺炎成人更强,足以限制新型冠状病毒感染以及附带损害。同时,参与抗氧化和抗炎过程的分子在新冠肺炎儿童中也被强烈激活,从而防止炎症的恶化和疾病的恶化。



文章四


首个基于中国汉族人群的冠心病mGWAS研究

Genome-wide association study of metabolites in patients with coronary artery disease identified novel metabolite quantitative trait loci


 ● 发表单位广东省人民医院

 ● 期刊:Clinical and Translational Medicine

 ● 影响因子:11.492

 ● 发表时间:2021.01


今年年初,广东省人民医院钟诗龙教授团队的研究成果刊登在“Clinical and Translational Medicine” 期刊上,这项研究在中国汉族人群冠心病(CoronaryHeart Disease,CAD)队列中进行了基于代谢组的全基因组关联研究(mGWAS),这也是汉族CAD人群的第一个大规模mGWAS研究。鉴定了7个新的代谢物数量性状基因位点(mQTLs)并揭示了这些mQTLs可能的临床意义。迈维代谢提供了血浆广靶代谢组的检测。



研究背景

冠心病(CoronaryHeart Disease,CAD)是全球最常见的心血管疾病类型,发病率和死亡率都很高。遗传变异可以解释大约10.6% 的 CAD遗传性,同时,CAD又与人体代谢密切相关。基于代谢组的全基因组关联研究(mGWAS)是发现重要的与代谢有关的mQTL的一种有效方法,它可以深入了解基因和代谢物之间的生物学联系和分子机制。迄今为止,已经发现了数百个mQTL,然而,大多数mGWAS 都是在欧洲人群中进行的,在中国人群中进行的研究数量有限。



研究设计

这项工作一共涉及来自三个临床中心的1551 名 CAD患者。发现集为广东省人民医院的1028名CAD患者,随访五年;验证集是来自三个中心的523名CAD患者(广东省人民医院、湘雅医院、中山大学附属第一医院),随访两年。使用广泛靶向的代谢组学的方法检测分析血浆样本中的代谢物,并从血细胞中收集DNA 进行基因分型。



研究结论

✦ 这项研究代表了中国CAD人群的第一次大规模mGWAS研究。

✦ 确定了7个可能是中国CAD 人群独有的新位点。

✦ 单样本MR 方法发现IPA 与 CAD患者的 MACE风险相关。

✦未来可能会通过更大的样本量深入了解IPA 和 MACE之间的关系,需要开展进一步的工作来揭示IPA 在该疾病发病机制中的作用。



文章五


大队列脂质组发现CAD患者新型预后标志物


 ● 发表单位广东省人民医院

 ● 期刊:Clinical and Translational Medicine

 ● 影响因子:11.492

 ● 发表时间:2020.09


2020年9月28日,Clinicaland Translational Medicine杂志在线发表了广州钟诗龙教授团队的最新成果“Insights into the prognosis of lipidomicdysregulation for death risk in patients with coronary arterydisease”,迈维代谢为其提供脂质组代谢检测服务。


研究背景

冠状动脉疾病(CAD)给现代社会带来了沉重的负担。每年CAD的发生率和死亡率都与癌症相当。虽然药物和手术治疗极大缓解了CAD危害,但是想精准预测CAD患者的预后并给予相应的治疗还是十分有挑战性的,因为每个CAD患者个体差异较大。为了能有效地分配有限的医疗资源给最高危的人群,目前急需可以评估CAD患者预后的新方法。虽然目前临床多种生物标志物的不同组合检测可以对CAD患者的预后起一定的指导作用,但是对CAD患者分子靶向治疗没有太多的帮助。因此,找到能对CAD预后风险进行有效分级和有助于深入了解CAD发病机制的生物标志物就显得十分重要。



研究设计




研究结论

(Cer(d18:1/20:1)、Cer(d18:1/24:1)、PE(30:2)、PE(32:0)、PE(32:2)、PC(O-38:2)、PC(O-36:4)、PC(16:1/22:2)、LPC(18:2/0:0)和LPE(0:0/24:6)这十种脂质和(Cer(d18:1/20:1)和LPC(20:0)这两种脂质,分别与死亡和MACE独立相关。Cer(d18:1/20:1)和Cer(d18:1/24:1)与左室重构相关。脂质组包含10种脂质和两种传统生物标志物,用于预测5年死亡风险,与传统模型相比具有显著更高的区分度,曲线下面积从76.56增加到83.65%,连续NRI值为0.634,IDI值为0.131。此外,还成功地用于区分低、中或高风险的多中心患者(P<0 .0001)。进一步分析表明,磷脂酰胆碱的双键数目和磷脂酰乙醇胺的碳原子含量与死亡风险负相关。



文章六


最新发现二甲双胍可改善肥胖引起的学习记忆问题


 ● 发表单位中山大学附属第一医院

 ● 期刊:Brain Behavior and Immunity

 ● 影响因子:7.217

 ● 发表时间:2021.07


肥胖引起的代谢紊乱是认知障碍和神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)的危险因素之一,而脑肠轴是目前热门的研究方向。近期,中山大学附属第一医院BrainBehavior and Immunity期刊上发表最新研究结果“Metforminrestores hippocampal neurogenesis and learning and memory viaregulating gut microbiota in the obese mousemodel”,迈维代谢在此次研究中提供16s检测和分析服务。



研究背景

肥胖的发病率在全球范围内呈上升趋势,已成为严重的公共卫生危机之一。肥胖作为代谢综合征的主要症状之一,与二型糖尿病(T2DM)、高脂血症、高血压、冠心病、脑卒中、肿瘤等多种疾病密切相关。这些疾病会危害患者的身心健康,降低患者的生活质量和预期寿命。此外,肥胖与糖尿病患者的认知功能障碍有关,许多证据表明,肥胖引起的代谢紊乱是认知障碍和神经退行性疾病(如阿尔茨海默病)的危险因素之一。


有证据表明,糖尿病治疗可以改善肥胖动物模型或患者的认知功能。二甲双胍(Met,一种常用的糖尿病药物)最早合成于20世纪20年代,但直到1957年,其在糖尿病治疗中的应用才获得临床批准。二甲双胍可以改善高血糖,而不会刺激胰岛素分泌或引起低血糖。其高效和安全的悠久历史使这种小分子药物成为二型糖尿病在世界范围内最常用的处方药。此外,据报道二甲双胍可能改善糖尿病啮齿动物模型的学习和记忆。肥胖是糖尿病的重要危险因素,因此改善肥胖期(糖尿病前期)齿状回神经元的再生对预防肥胖相关代谢紊乱引起的认知障碍和阿尔茨海默病具有重要意义。然而,长期服用二甲双胍对肥胖小鼠海马神经元再生和认知的影响仍然未知。



研究设计



研究结论

本研究表明二甲双胍改善肥胖小鼠的肠道微生物群组成,这可能抑制神经炎症,防止海马新生神经元的衰退,从而改善肥胖小鼠的学习和记忆。本研究发现可能为预防肥胖相关的脑损伤和糖尿病提供一个新思路。



文章七


藜芦醇以foxo1依赖的方式促进小鼠后肢缺血血管生成


 ● 发表单位中山大学附属第一医院

 ● 期刊:Molecules

 ● 影响因子:4.411

 ● 发表时间:2021.12



研究背景

危重肢体缺血(Criticallimb缺血,CLI)是一种严重的外周动脉疾病(peripheralartery disease, PAD),严重危害人类健康。治疗性血管生成是CLI的重要治疗策略,目前开发的促进血管生成的药物是有限的。


白藜芦醇(Resveratrol,RSV)是一种从植物中提取的多酚类化合物,具有抗氧化、抗炎和抗癌等多种作用。RSV是否对CLI有保护作用尚不清楚。研究者利用代谢组学来筛选RSV干预后改变的代谢途径迈维代谢为本研究提供了TM广靶代谢组检测分析服务。



研究结论

本研究发现口服RSV显著改善了小鼠后肢缺血,并增加了磷酸化FoxO1的表达。RSV治疗人脐静脉内皮细胞(HUVECs)可增加FoxO1的磷酸化及其胞质重新定位,促进血管生成。在HUVECs中验证RSV对血管生成的影响是FoxO1依赖的。代谢组学筛选发现RSV对缺血肌肉的有益作用与嘧啶代谢、嘌呤代谢以及丙氨酸、天冬氨酸和谷氨酸代谢途径高度相关。本研究为CLI的医学治疗提供了一个新的方向。



文章八


ANIT所致的肝内胆汁淤积可引起肠肝轴紊乱


 ● 发表单位广州中医药大学、西藏藏医药大学

 ● 期刊:Environmental Toxicology and Pharmacology

 ● 影响因子:4.89

 ● 发表时间:2021.05


广州中医药大学熊天琴团队与西藏藏医药大学泽仁达瓦团队共同在Environmental Toxicology and Pharmacology(环境毒理学与药理学)期刊上发表最新研究结果“Intrahepatic cholestasis induced byα-naphthylisothiocyanate can cause gut-liver axisdisorders”,迈维代谢在此次研究中提供了粪便样本中的胆汁酸检测和分析服务。




研究背景

α-萘基异硫氰酸酯(ANIT) 是一种常规的胆汁淤积建模剂,可对肝脏的小胆管造成炎症性损伤,并诱导肝内胆汁淤积损伤肝细胞。其损伤特征类似于临床原发性胆汁性胆管炎(PBC)。PBC可导致肠绒毛缩短、乳糜泻和肠道菌群失衡。但PBC引起肠道损伤的机制尚不清楚。


肠肝轴理论认为多种介质连接肠道和肝脏,胆汁酸是这些必需介质之一。胆汁酸通过胆汁酸受体(例如法尼醇X 受体 (FXR)介导的多种胆汁酸蛋白)实现胆汁酸肝脏循环,以维持正常的肝脏和肠道功能。


粪便中胆汁酸组成的变化与肠道损伤密切相关。一些胆汁酸对肠道具有细胞毒性。例如,鹅去氧胆酸(CDCA) 可诱导肠道氧化和炎症损伤,而牛磺胆酸(TCA) 也已被证明与肠道炎症有关。


研究设计

这项研究比较了两种胆汁淤积模型:接受单次皮下注射 ANIT(75 mg/kg) 的单次注射模型,以及每隔一天注射一次 ANIT(50mg/kg) 持续 2 周的多次皮下注射模型。使用 Transmetil(腺苷蛋氨酸 1,4-丁二磺酸盐)来缓解多次注射组的肝内胆汁淤积。实验设计如下图:




研究结论

多次皮下注射ANIT引起的肝内胆汁淤积会导致更严重的肝纤维化、肠屏障损伤、肠氧化、炎症损伤。其机制可能与粪便中胆汁酸组成的改变及回肠FXR的改变有关。胆汁酸与细菌的相互作用,可能进一步阐明胆汁淤积致肠道损伤的机制。



文章九


六君子汤治疗顺铂引起的厌食症


 ● 发表单位广东药科大学

 ● 期刊: Journal of Ethnopharmacology

 ● 影响因子:4.360

 ● 发表时间:2021.11


近日,“Journal of Ethnopharmacology”(民族药理学期刊)发表了广东药科大学中药学院聂克教授团队在中药治疗机制方面的最新研究成果。通过建立大鼠疾病模型,证实了传统中药六君子汤在治疗顺铂引起的厌食症方面的疗效,并探究和讨论了可能的治疗机制和代谢途径。迈维代谢为此次研究提供了大鼠血清广靶代谢组检测和分析。


研究背景

顺铂是一种强大的化疗药物,常用于癌症患者,但其使用通常会导致不良副作用,包括厌食、恶心和呕吐。化疗引起的厌食症(CIA) 会导致食欲不振和早饱,从而导致癌症患者无意识的体重减轻、厌恶食物、营养不良甚至恶病质。顺铂诱导的厌食症也与Janus 激酶(JAK)/信号转导和转录激活剂(STAT) 信号通路有关。  


六君子汤(LJZD)是中国传统方剂,起源于《医学正传》,在治疗化疗引起的厌食症方面有较好的疗效。临床医生已有效地使用LJZD 治疗厌食症,并且已经证明LJZD 与孕激素治疗相比副作用显着减少,但其潜在机制尚未得到充分研究。


研究设计



研究结论

本研究在顺铂诱导的厌食啮齿动物模型中验证了LJZD 对 CIA的作用,并分析了 LJZD是否通过 JAK-STAT信号通路起作用以改善厌食。LJZD改善顺铂诱导的食物摄入和水消耗量的减少,以及胃窦、肝脏、回肠的损伤。并且LJZD治疗CIA的机制与IL-6介导的JAK-STAT信号通路抑制、代谢紊乱调节、瘦素、下丘脑促食欲肽水平升高、饥饿素、GDF15和下丘脑促食欲肽水平降低有关。首次结合网络药理学和代谢组学方法来研究LJZD 的潜在机制,并提出可能有助于未来研究的可能靶点、生物进展、细胞成分、分子功能、信号通路和代谢通路。




迈维代谢



武汉迈特维尔生物科技有限公司(简称“迈维代谢”)位于武汉国家生物产业基地--光谷生物城,专注于提供领先的代谢组学及多组学技术开发及服务。迈维代谢创新了"广泛靶向代谢组"技术,基于“代谢组+基因组+转录组”的技术路线,近年来以通讯作者身份在Cell、Nature Genetics、Nature Communications、PNAS、National Science Reviewzen等国际学术期刊发表多篇论文,引领基因组时代的代谢生物学研究新方向。

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