布鲁克液质timsTOF SCP

timsTOFSCP重新定义了单细胞蛋白质组学的概念。它专为深度无偏的4D定量单细胞蛋白组学、免疫肽组学、表观蛋白质组学和翻译后修饰组学（PTM）而设计，与scRNA-seq技术相辅相成，拓展了单细胞研究的视野。

高灵敏度：采用开创性的新离子源几何设计，提高离子传输效率5倍，并带来更高的稳定性。数据更完整：采用非依赖性采集数据的方法，超越定量重复性的极限，为大规模研究细胞异质性铺平道路。超快采集速度：将高采集速度与灵敏的dia-PASEF技术相结合，可采用短色谱梯度进行样本分析，减少样本量分析时的色谱稀释效应。更稳定：无需仪器清洗，即可连续分析数千个样本。

先进的离子透镜和PASEF技术，能从单个细胞中发现细胞异质性和生物学特性。timsTOFSCP采用全新改进的离子源概念，结合平行积累连续碎裂（PASEF®）采集方法的优势，提供了极高的速度和灵敏度，以应对单细胞的蛋白组或后几个细胞的翻译后修饰的分析挑战。

革命性的离子传输技术采用经过改进的离子源几何设计，提高离子传输效率5倍，并增加离子漏斗和真空系统的压力级。全新的设计提高了离子在离子源里的传输，更高的真空度维持了仪器的稳定性，改进让离子传输提升近5倍。

双TIMS，CCS支持的分析利用CCS辅助的平行累积连续碎裂（PASEF®）分析，对数据进一步的分析提供了很多可能性，降低误发现率。

免疫肽组学和其它富集工作流程的理想检测工具，对一些需要进行肽段富集的工作流程提供了出色的灵敏度，比如免疫肽组学研究。

PaSERRun&Done——无偏单细胞分析数据的实时质量控制，timsTOFSCP可以以超过120Hz的扫描速度，对数百个微量样本进行分析。

在蛋白质组学研究中，有一种全新的方式，虽然增加了数据量，但也为数据分析提出了新的要求。数据分析已经成为许多工作流程中常见的瓶颈。
现代分析方法需要使用timsTOFSCP生成数百个数据，布鲁克已经推出了实时数据库搜索功能——实时并行数据库搜索引擎（PaSER），从而消除了这一障碍，
使用PaSER，LC-MS运行一旦完成，结果就即使呈现，也就是“Run&Done”。MaxQuant/Perseus和PEAKSStudio数据处理开放式数据格式允许研究人员直接使用原始数据，并使用自己选择的行业领先软件。
MaxQuant软件通过保留时间、离子淌度、质量和信号强度来提取4维（4D）特征，从而有助于肽、蛋白质和翻译后修饰的鉴定和定量。
PEAKSStudio将denovo测序与传统数据库搜索相结合，并对timsTOF原始数据的处理进行了优化。超高灵敏度的dia-PASEF加持的4D-蛋白质组学CCS支持的分析使鉴定更可靠。
timsControl允许针对感兴趣的离子进行dia-PASEF窗口的自定义，并能调整质量隔离窗口，TIMS的扫描范围，和循环时间，以使dia-PASEF方法适应不同的色谱方法有趣的离子。结合EvosepOne系统的低流速方法与timsTOFSCP高灵敏度的dia-PASEF方法，可从500pg细胞消化液内鉴定出超过2,000个蛋白质，从250pg的细胞被鉴定出超过1,500个蛋白质。
这展示了真正的单细胞蛋白质组学所需的灵敏度。从250pg中鉴定出的蛋白质的丰度范围约为4个数量级，可以在单细胞水平上进行蛋白质组定量分析。
探索肿瘤微环境理解TME及其浸润性免疫细胞可被认为是影响疾病进展、治疗反应和患者生存的关键步骤。
凭借其高灵敏度，timsTOFSCP能够在FFPE组织样本的激光捕获显微切割（LMD）获得的细胞上获得足够的蛋白质组深度。
在timsTOFSCP仪器上，细胞标记物用于识别肿块中的黑色素瘤癌细胞和那些与基质密切相关的细胞，随后通过LMD对这两个群体分割，然后进行无偏4D-蛋白质组学分析。
关键发现：富集分析揭示了中枢和外周黑色素瘤细胞之间的差异调控蛋白，有可能进行疾病分型以指导临床决策。
结果由MatthiasMann教授提供(doi: https://doi.org/10.1101/2020.12.22.423933)"我总是说，单细胞蛋白质组学不会发生在我有生之年，但我很高兴这个说法被证明是错误的。"MatthiasMann教授，德国Max-Planck生物化学研究所蛋白质组学和信号转导系主任

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注：该产品未在中华人民共和国食品药品监督管理部门申请医疗器械注册和备案，不可用于临床诊断或治疗等相关用途