液质布鲁克timsTOF Pro 2

timsTOFPro2采用PASEF®技术，驱动4D-蛋白质组学和4D-脂质组学，用于无偏向性细胞和血浆蛋白质组学、液体活检多组生物标志物发现，并整合基因组学、蛋白质组学和表观蛋白质组学。4D-组学时代—— 解锁第四维度的价值。PASEF技术实现了超过120Hz的扫描速度，而不影响分辨率。额外一维离子淌度提高了数据完整性。超快数据采集速度使其可以使用短梯度实现生物样本的高通量分析。独特的仪器设计使得其可以连续分析数千个样品，而无需清洁。更快速度实现蛋白质组全覆盖基于质谱的蛋白质组学一次可实现样本里成千上万蛋白的定性和定量。timsTOFPro2使用PASEF®的技术可实现极高的扫描速度和灵敏度，只需要少量样本就可以达到蛋白质组学鉴定新深度。
TIMS首先是一项重要的气相分离技术，它可大大降低样品分析复杂度，提高峰容量和分析物鉴定可靠性。TIMS离子淌度管能对离子实现时间和空间上的聚焦，从而独特地提高灵敏度和扫描速度。TIMS技术可以实现近乎100%的离子利用率。CCS额外一个维度信息能够提供很多进一步的分析可能性，可以从复杂数据库实现化合物的高可信度库匹配以及更低的错误发现率（FDRs）。
timsTOFPro2质谱仪整合了新一代TIMS分析仪和一个完全重制的不锈钢堆叠环形离子向导（SRIG），提供了三倍高的离子容量。PASEF®重新设计的MS/MS技术，以满足蛋白组学的速度要求。TIMS模块独特设计意味着离子在前一根淌度管内累积，在后一根淌度管内根据离子淌度值分批释放，可以实现近乎100%的离子利用率，几乎不造成离子的损失。
timsTOFPro2卓越稳定性意味着仪器可以长时间运行，而没有明显的信号和其它性能下降。PaSER（实时平行搜索引擎）能够实现基于样本序列管理的实时数据库搜索引擎，提供极快的搜索速度。PaSER有效地打破了大队列样本数据分析通量壁垒，使实时蛋白组学的非标记定量也可以跨越PaSER获得的数据结果集。通过TIMSViz，用户可以可视化淌度偏移质量对齐，实现共洗脱多肽的鉴定和识别。

dia-PASEF比传统的DIA方法有更高的灵敏度和选择性，因为它结合了DIA的优点和PASEF离子利用率高的优势，增加了鉴定的可信度。TIMS分离提高了选择性，同时可以排除单电荷母离子，降低本底噪音干扰。dia-PASEF利用分子量和碰撞横截面CCS值的相关性，实现了高可信度的化合物鉴定。在LC-MS/MS分析中，dia-PASEF能够采集包含m/z，离子淌度值（CCS），保留时间和离子强度的4D数据。使用timsTOFPro2单针能够达到前所未有的蛋白组学覆盖深度。prm-PASEF在单针中极大地提高了监测多肽数目，同时保持了仪器选择性和灵敏度。该技术可以增加检测的灵敏度，对于大量目标肽的完整数据提出了解决方案。prm-PASEF利用了timsTOFPro2的第四维分离和PASEF技术的速度，极大提高了靶向分析离子数量。timsTOFPro2在使用超高灵敏度的质谱仪对低样本量进行原型定量方面非常重要。dia-PASEF方法多针测试结果有着很高的重复性。使用Aurora-25cm柱在60分钟梯度下可以实现接近8,000个蛋白的定量和超过70,000条多肽的鉴定，拥有极高的定量准确性。dia-PASEF在timsTOFPro2上实现了低样本量的磷酸化蛋白质组学分析。基于TiO2富集时，使用150ug蛋白富集起始量就能够鉴定27,768个磷酸化肽。

StefanTenzer教授表示，timsTOFPro质谱仪不仅具有高灵敏度，还具有基于气相的位置异构磷酸化多肽分离能力，可以为理解信号传导通路提供更详细的信息。

StefanTenzer教授是位于德国美因茨约翰内斯·古登堡大学医学中心免疫学研究所的教授。

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