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Matthias Mann教授谈timsTOF Pro在临床蛋白组学中的应用前景

发布时间: 2020-01-08 16:05 来源:布鲁克(北京)科技有限公司-质谱仪器

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  Matthias Mann教授的研究团队(德国Max Plank生物化学研究所和丹麦哥本哈根大学)做为全球顶尖蛋白组学研究团队之一,一直致力于开发新的质谱技术和新的蛋白组学研究方法,基于timsTOF Pro的4D蛋白组学平台就是由布鲁克和Matthias Mann团队共同开发,因此他们团队是也是早的timsTOF Pro用户,他在德国Max Plank生物化学研究所和丹麦哥本哈根大学的两个团队目前已经拥有5套timsTOF Pro系统,并同时在开展多个方向的研究,比如代谢组学、单细胞蛋白组学和临床蛋白组学等。    1578472908555296.png

  视频专访:最近News Medical针对临床蛋白组学研究的问题,对Matthias Mann教授进行了一次深入的采访,通过访谈内容,我们能详细了解到目前临床蛋白组学研究对人类疾病诊断的重要性以及timsTOF Pro在临床蛋白组学研究的应用前景。

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  布鲁克推出的基于timsTOF Pro的4D蛋白组学平台,因采用TIMS(捕集离子淌度)技术和PASEF (平行累积连续碎裂)技术,从而实现了近100%的离子利用率和超过120 Hz二级扫描速度。此4D蛋白组学平台发布两年多以来,已经得到越来越多的蛋白组学研究团队认可并开始使用此革命性技术,一方面,是因为过去两年多已经有大量的数据证明,timsTOF Pro的采集速度和灵敏度的同时提升大大突破了蛋白组学研究现有瓶颈,这提高了基础蛋白组学研究的水平;另一方面,timsTOF Pro灵敏度和扫描速度上的独特优势,意味着所以可以用更低的进样量和更短的色谱梯度鉴定到更多的蛋白,同时离子淌度的维度的引入,更是大幅提高非标记定量的数据完整性,这些特点对基础蛋白组学研究向临床蛋白组学应用的转化至关重要。

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  采访中,为了使采访者对timsTOF Pro的特点有更直观的感受,Matthias Mann教授通过几个具体实例阐述了timsTOF Pro的独特应用:

  • 将Evosep液相与timsTOF Pro联用,最大限度发挥timsTOF Pro 扫描速度和灵敏度的优势,真正实现高通量临床蛋白组学研究;

  • timsTOF Pro高灵敏度与激光微切割技术(Laser Capture Microdissection)结合,将PASEF技术用于FFPE(Formalin Fixed Paraffin-Embedded)样本微小区域组学研究,从而将蛋白组学技术与临床病理学完美结合;

  • timsTOF Pro能准确并高度重复测定多肽CCS(碰撞截面积),从而可以利用Machine Learning (机器学习)来预测多肽的CCS,使多肽的鉴定除了时间和精确质量外又多了一个定性的参数,从而多肽的鉴定更可靠,这对将来利用Machine Learning 来对病人进行分型也大有帮助。

  如果您对采访的更多细节感兴趣,可以访问如下链接阅读采访原文:

  阅读原文

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