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HORIBA海外用户简讯|牛津大学开创单细胞水平微生物代谢研究新方法

发布时间: 2018-07-18 21:21 来源:HORIBA科学仪器事业部

供稿:Sophie

编辑:Joanna

微生物在生态系统中扮演重要角色。研究微生物的技术手段多样,却各有利弊:测序技术、质谱和核磁共振结合技术多用于整体分析,能够获取微生物系统发育和宏基因组学特征信息,但掩盖了微生物群体中的高度多样性;二代质谱可以分析单个细胞,但对细胞有破坏且费用高昂。相比于以上的方法,基于稳定同位素的拉曼单细胞光谱方法可以实现对单细胞的无损标记。

在此背景下,英国牛津大学工程科学系提出了新设想,即利用拉曼单细胞光谱结合氘同位素标记的方法研究氘化碳源在单细胞中的同化吸收。

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英国牛津大学
(图片转自网络)


相比于对C标记,对碳源中的H氘化这种方式,成本低,还能标记复杂底物。实验利用HORIBA共聚焦拉曼光谱仪获得单细胞光谱(SCRS),在2070-2300 cm-1谱段发现可区分的C-D振动带,且C-D带的强度与碳源氘化的程度成正比。实验证明了拉曼-氘同位素标记不仅可以指示微生物利用氘化碳源的代谢活动,还可以通过分析光谱揭示不同的代谢途径。

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单细胞拉曼光谱图(SCRS)


利用低成本和多功能的氘化底物,拉曼-氘同位素标记在单细胞水平上探索代谢途径和功能上很有潜力  。

更多研究详细信息可查阅:Analytical Chemistry,DOI: 10.1021/acs.analchem.7b03461扫描二维码查看英文原文。

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