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岛津应用:MALDI-TOF快速准确分析蛋白质C-末端氨基酸序列

发布时间: 2015-06-09 00:00 来源:岛津企业管理(中国)有限公司/岛津(香港)有限公司

  通过肽质量指纹图谱识别蛋白需要将蛋白酶解后,使用质谱来分析酶解产物,然后检索数据库来确认得到的序列片段。然而,通过检索数据库来确定N-和C-末端序列却并不容易。原因在于:1)处理和翻译后修饰经常导致蛋白质N-和C-末端结构发生变化;2)离子抑制效应的存在导致部分蛋白序列不可测定。蛋白N-末端氨基酸序列可以使用蛋白测序仪(PPSQ-31A/33A)或者蛋白N-末端测序组件(ORFinder-NBTM)来检测。然而,对C-末端结构来说,检测技术的需求使得蛋白末端氨基酸序列分析变得比以往更为重要。

  本文以包含有特征C-末端蛋白的样品为例,介绍一种全新的、以质谱分析氨基酸序列的成功例子。使用LysC酶解蛋白样品,以TMPP-Ac-OSu对酶解产物进行衍生化修饰,并用DITC树脂进行分离后,以岛津AXIMA Performance检测确定了蛋白C-末端氨基酸序列。

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  岛津AXIMA Performance

  AXIMA PerformanceTM作为岛津功能全面的科学研究级MALDI-TOF-TOF仪器,性价比高,是大学,科研单位用户的首选机型。可以全面的开展高通量蛋白质组学研究,包括多肽,蛋白分子量测定,蛋白鉴定,多肽序列分析,翻译后修饰研究,如磷酸化,糖基化研究等。高通量自动化蛋白鉴定,高分辨双离子门,高能CID技术进行MS/MS,新型曲线场反射器等尖端技术是该仪器成为蛋白质组学研究的有利工具。LMZ(low mass zoom)功能是该仪器的一个优势,可以对低质量端的谱图优化,得到优秀的低质量端数据,如亚氨离子的信号得到增强,帮助MS/MS谱图的准确解析。

  了解详情,敬请点击《MALDI-TOF 快速准确分析蛋白质C-末端氨基酸序列》


标签:蛋白 末端 氨基酸序列
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