岛津推出“酵母中代谢酶LC/MS/MS MRM数据库”

　　定量蛋白质组学是通过LC/MS/MS测定肽段（由胰肽酶酶解蛋白质得到），从而对蛋白质定量的技术，因为其高灵敏度和高选择性且无需抗体，将成为体内蛋白定量的好方法。此数据库可提供用于酵母中代谢酶的定量蛋白质研究时所需的MRM信息。使用微生物诸如酵母用于酿造、化工和药物领域的生产有很长时间的历史，近些年来开始用于生物燃料的研发过程。在生物燃料的生产过程中，将来自于生物质的糖转化为燃料主要涉及中央代谢途径，诸如：糖酵解和TCA途径，或者戊糖磷酸化途径。另外，通过改变代谢酶、控制表达水平等方式改变代谢途径，来提高有用物质的产量的研发正在进行。在这些代谢途径的分析中，代谢酶的分析是非常重要的。

　　为此，岛津公司近日推出“酵母中代谢酶LC/MS/MS MRM数据库”。

　　稳定同位素标记技术用来分析在不同生长条件或基因型下样品中代谢酶的不同丰度。下图展示了典型的实验流程。蛋白提取自含有标记葡萄糖（12C 和13C）的培养基抚育的酵母，标记的蛋白混入其中参与测定。此数据库包含了参与酵母中央代谢途径的288个酶的测定的MRM离子对。

　　“酵母中代谢酶LC/MS/MS MRM数据库”的特点

　　1) 提供代谢酶分析所需的MRM条件

　　要分析大量蛋白质，需要摸索海量的MRM条件。MRM数据库包含了此类的分析条件，方便用户开始分析工作。通过使用这些在实验室已经验证过的方法，花费在方法开发上的时间显著减少。

　　2) 可以分析由胰肽酶酶解的来自于芽殖酵母的228种初级代谢相关的酶

　　数据库有3584MRM对离子，包括13C标记同位素。该数据库包含了来自于芽殖酵母的228个酶通过酶解产生的498个肽段的1792MRM离子对，可用于生物乙醇的生产，也可用于基础研究的生物模型。通过使用这一数据库，酶的主要代谢途径，诸如：糖酵解、TCA途径，戊糖磷酸化途径和氨基酸代谢均可倍测定。

　　3) 提供MRM分析条件，利用稳定同位素进行比较

　　对于所有的MRM离子对都包含了对应的13C标记同位素肽段MRM分析条件。通过使用这些，可以进行比较分析。例如：一个基因缺陷的酵母在未标记葡萄糖生长与在标记的葡萄糖中生长的质控组进行比较。

　　4) 简单得自定义方法

　　方法参数列表包含在产品中，用户可根据自己的测定需要自定义新方法。

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