SeqStudio Flex应用篇 | DNA分子指纹技术为品种鉴定保驾护航

2023-02-06 10:18:03, ABI 赛默飞世尔科技生命科学产品


以农为本,品种鉴定刻不容缓

种业被称为农业的“芯片”,随着育种和种业的快速发展,一方面常见作物(如,玉米,水稻等)品种急剧增加;另一方面种子的仿冒,一品多名、张冠李戴等问题越来越突出。农作物品种造假、套牌等侵权行为一直是种子质量管理的重点和难点。所谓国以农为本,农以种为先。所以,如何做好品种鉴定也是粮食战略安全、农业振兴的重中之重。


DNA指纹技术用于品种鉴定

DNA指纹技术是通过检测DNA水平上的遗传差异来鉴定农作物品种,具有准确、高效、不受环境因素影响,可鉴定表型上难于鉴别的品种等优点。与传统技术相比,DNA指纹技术表现出特异性、遗传性、稳定性和高位点性、鉴定周期短,在植物品种鉴定方面也表现出独特的优势而得到广泛应用,展示了广阔的应用前景


目前,用于农作物品种鉴定中DNA指纹分析的分子标记有AFLP(扩增片段长度多态性) 、RAPD(随机扩增多态性)SSR(简单重复序列)等。RAPD具有简单快捷经济的优点,但多态性不高,结果重复性欠佳;AFLP多态性高,但操作步骤复杂,对实验技能及仪器设备的精密度要求很高,加之是专利技术,限制了其在实践中的应用;SSR既具有RAPD简单快捷经济的优点,又兼具AFLP多态性高的优点,且重复性和稳定性高,特别适合用于品种鉴定


SSR简单重复序列分子标记技术:品种鉴定的“金标准”

最初检测SSR多以PAGE电泳分离序列,分辨率一般且无法对结果数字化。随着毛细管电泳(CE)技术的发展,大大提高了片段分析的准确度(可精确到1bp),配合相应的分子标准品,使不同批次间的样品数据具有可比性。2015年,《农作物种子检验规程真实性和品种纯度鉴定》做出重大修改,将DNA分子检测的方法加入进品种真实性验证或身份鉴定中:借助重复序列SSR和单核苷酸多态性SNP等分子标记法,通过DNA指纹数据库相比对判断种子身份

 

随后,我国在2016年颁布了《植物品种鉴定 DNA分子标记法总则》NY/T 2594-2016。该标准适用毛细管电泳(CE)基因分析平台,同时引入了该平台对不同位点的扩增信息的收集和数字化处理。在该总则下,已衍生相关的行业标准,涵盖小麦、玉米、高粱、甘蔗、豌豆、苹果等绝大多数主要农作物。

 

全国农作物品种DNA指纹库公共平台建成启用

在全国农业技术推广服务中心的牵头下,全国农作物品种DNA指纹库公共平台于2022年4月24日正式上线。该平台集成了农作物品种SSR、SNP等指纹数据信息,已有玉米、水稻、小麦、向日葵等作物1.6万个品种SSR、SNP指纹数据入库。该平台具备查询、比对、鉴定、分析等4大功能模块,可为市场打假、品种管理和育种创新等主体提供实时查询比对指定品种指纹异同、筛查推断未知品种身份等服务。

 

SeqStudio Flex创新上市助力品种鉴定

作为赋能科技进步的全球领导者,赛默飞始终致力于推动标准化分子检测,利用CE平台通过SSR简单重复序列分子标记进行品种鉴定,建立适合不同作物SSR-PCR技术体系。基于CE平台进行SSR检测(配合常见的核酸提取方法)、全流程操作简便、稳定性及重复性好,且全自动毛细管电泳基因分析平台明显降低成本且易于数据标准化

赛默飞最新推出Applied Biosystems SeqStudio Flex毛细管电泳基因分析仪,基于十分成熟的荧光毛细管电泳(CE)技术,通过优化设计和先进的通信功能提高其灵活性、易用性、连通性和可维护性,可更好地满足不断强化的品种真实性鉴定的需求,用于分子辅助育种、品种管理等。


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