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全自动、高通量对大量植株进行成像 特别适合植物功能基因组学和植物表型组学 遗传育种、突变株筛选、表型筛选的强大工具 机器人技术、图像分析和大规模计算能力的完美结合
实验室高通量植物成像系统——Scanalyzer HTS是一套可以全自动、高通量对大量小植株进行成像的系统,可以选择配置可见光(VIS)成像、近红外(NIR)成像、红外(IR)成像、荧光成像或激光扫描3D成像(只适合高度15 cm以下的小植株)中的一种或多种。成像系统带程控移动装置,可以在X轴和Y轴上进行移动,并配有射频或条形码读取器。Scanalyzer HTS系统通过软件控制摄像头移动到样品上方(多孔板或小盆)进行拍照,照片数据与该样品的电子标记(射频或条形码)一起存储。软件也可控制摄像头对多孔板上的每个孔进行单独成像,每个孔的数据分布存储(告诉软件多孔板类型,然后自动编码,如A01、A02……)。(下载演示视频) 软件可以控制系统每天自动对样品进行成像,获得样品成像的时间动力学变化。只要点击样品的编码,就可以获得样品的图像及分析数据的时间动力学变化,并可进行复杂的统计学分析和图表分析。 系统提供顶部光源和底部光源,并可通过软件控制光强变化。根据测量样品数目的多少,可以选择配置4、24、48或72个多孔板的版本,不同版本的外观尺寸差别很大。如有特殊需要,可以定制更大版本。 由于全自动、高通量测量获得的数据非常庞大,本系统必须配置服务器来存储数据。选购PHP远程数据库软件,还可以对系统进行远程原理、控制和分析。 主要功能 ◆ 全自动、高通量对植物等小型样品进行可见光成像、近红外成像、红外成像、荧光成像(包括整株GFP成像)和/或激光扫描3D成像(每套系统可选择一种或多种) ◆ 通过可见光成像可以测量植物的结构、宽度、密度、对称性、叶长、叶宽、叶面积、叶角度、叶颜色、叶病斑、种子颜色、种子颜色面积等等50多个参数 ◆ 通过近红外成像可以分析植物的水分分布状态、水力学研究、胁迫生理学研究等 ◆ 通过红外成像可以进行植物干旱胁迫研究、蒸腾研究等 ◆ 通过荧光成像可以分析植物的生理状态 ◆ 样品可以是培养在多孔板中(如12、24、48、96、384孔板),也可以是长在小花盆中。 ◆ 高通量测量大量样品,标准配置可选择装4、24、48或72个多孔板的版本 ◆ 花盆大小范围,直径3.64 ~ 20.51 cm,高2.79 ~ 15.44 cm ◆ 可选择成像分辨率,特别适用于96孔板高精度测量 ◆ 进行动物/昆虫的游动/运动测试时,可自动获取图像 应用领域 植物功能基因组学、植物表型组学、遗传育种、突变株筛选、植物生理学、农业科学、植物病理学、植物形态建模、植物生物信息学、种子生理学、种子病理学、植物胁迫生理学、植物水力学等研究领域。 HTS系统的成像扫描模式
整个多孔板像素
每个孔的像素
每个板扫描1次
1 228 800
12 800
每个板扫描4次
4 915 200
51 200
每个板扫描9次
11 059 200
115 200
每个板扫描16次
19 660 800
204 800
每个板扫描96次
117 964 800
热水处理部分叶片(红框区域)后的可见光成像原始照片和软件成像
热水处理部分叶片(红框区域)后的荧光成像原始照片和软件成像
t = 0 d
t = 4 d
t = 7 d
t = 11 d
基于面积的植株生长动力学曲线
利用表型参数的雷达图进行植株分类 南芥表型参数的静态雷达图(“指纹图谱”) 利用5种参数做的雷达图,分类结果用颜色显示。数据为拟南芥生长到第13天时的结果。
实验室高通量植物成像系统,Scanalyzer HTS
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