项目文章 | 转录组测序34分文章三连发！欧易的合作科学家是怎么做到的？

欧易生物合作项目高分文章频发，小编整理了 3 篇在 12 月上旬陆续发表的欧易生物转录组测序项目文章，累计影响因子 34 分！恭喜合作科学家团队！

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靶向 YAP1/LINC00152/FSCN1 信号轴可预防结直肠癌进展

Targeting YAP1/LINC00152/FSCN1 Signaling Axis Prevents the Progression of Colorectal Cancer

期刊：Advanced Science

IF：15.804

作者单位：中南大学肿瘤研究所

研究内容：肿瘤中 YAP1 作为转录激活因子的作用研究较为透彻，但 YAP1 对 lncRNA 的调控研究相对较少。本研究结果显示 lncRNA LINC00152 在结直肠癌（CRC）样品中高表达，并且 LINC00152 与 YAP1 表达量呈现显著正相关。进一步研究证实，YAP1 通过 TEAD1 辅助结合在 LINC00152 启动子区域起到直接调控 lncRNA 转录的作用。转录组测序结果显示在 CRC 中 LINC00152 与 FSCN1 表达存在显著的正相关，研究发现 LINC00152 竞争性结合 miR-185-3p 和 miR-632 以靶向调控 FSCN1 的表达，通过 ceRNA 作用机制发挥促进肿瘤发生和转移的作用。因此，靶向 YAP1/LINC00152/FSCN1 信号轴有望作为 CRC 临床治疗的新途径。

转录组测序显示 LINC00152 影响肿瘤相关基因表达

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人胶质母细胞瘤 CYP46A1 缺失介导引起的胆固醇稳态改变的治疗意义

Therapeutic implications of altered cholesterol homeostasis mediated by loss of CYP46A1 in human glioblastoma

期刊：EMBO Molecular Medicine

IF：10.624

作者单位：山东大学齐鲁医院

研究内容：胆固醇代谢失调是包括胶质母细胞瘤（GBM）在内的许多肿瘤的标志，但在疾病进展中的作用还缺乏深入研究。本研究鉴定了一种大脑特异性酶 CYP46A1，它负责通过将胆固醇转化为 24(S)-羟基胆固醇（24OHC）来消除胆固醇以维持脑内胆固醇代谢的平衡。与对照脑组织相比，GBM 中 CYP46A1 表达量显著下调，并且 CYP46A1 表达量的降低与神经胶质瘤恶性程度增加和预后不良有关。CYP46A1 的异位表达通过增加 24OHC 的水平来抑制细胞的增殖和肿瘤的生长。转录组测序显示，用 24OHC 处理 GBM 细胞可以通过调节 LXR 和 SREBP 脂代谢信号通路抑制肿瘤生长。同时，利用化合物激活 CYP46A1 的表达也可以达到抑制 GBM 生长的作用。因此，通过干预胶质母细胞瘤胆固醇稳态调控网络中的 CYP46A1/24-OHC 轴可能为相关患者的治疗提供新的途径。

转录组测序显示 CYP46A1/24-OHC 轴调控脂代谢相关信号通路

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通过抑制机械张力诱导的 YAP 激活维持体外肝细胞功能

Maintenance of Primary Hepatocyte Functions In Vitro by Inhibiting Mechanical Tension-Induced YAP Activation

期刊：Cell Reports

IF：7.815

作者单位：第二军医大学

研究内容：肝细胞是肝脏的主要功能性细胞，执行其代谢、排毒和内分泌功能。功能性肝细胞在药物发现和评估以及肝病的细胞治疗中非常有价值。然而，在体外维持肝细胞的功能是一项长期的挑战。短期培养后，即使是新鲜分离的肝细胞也失去了必要的功能，背后的原因尚不清楚。本研究发现，机械张力诱导的 YAP 蛋白质激活触发肝细胞去分化，而通过限制细胞扩散来缓解机械张力足以抑制肝细胞去分化。基于此发现，后续通过重复化学筛选确定了一种小分子混合物 LBDXL，该混合物可通过靶向肌动蛋白聚合和肌动球蛋白收缩来长期维持肝细胞功能和体内再繁殖能力。本研究揭示了肝细胞去分化的机制，并探索建立了体外维持肝细胞功能的可行方法。

转录组测序显示 LBDXL 培养基可以体外维持肝细胞状态

参考文献

1.Ou C, Sun Z, He X, et al. Targeting YAP1/LINC00152/FSCN1 Signaling Axis Prevents the Progression of Colorectal Cancer. Adv Sci 2019; doi: 10.1002/advs.201901380.

2. Han M, Wang S, Yang N, et al. Therapeutic implications of altered cholesterol homeostasis mediated by loss of CYP46A1 in human glioblastoma. EMBO Mol Med 2019; doi: 10. 15252/emmm.201910924.

3. Sun P, Zhang G, Su X, et al. Maintenance of Primary Hepatocyte Functions In Vitro by Inhibiting Mechanical Tension-Induced YAP Activation. Cell Rep 2019; 29(10): 3212-3222 e4.

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