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如何高效做好 RNA 质控

发布时间: 2018-03-19 11:02 来源:杭州厚泽生物科技有限公司

作为被生物医学界广泛关注的核酸家族的一大成员,RNA 一直是科研工作者持续进行深入研究的重点,而不论是总 RNA 还是 mRNA,亦或是近年来比较热门的 miRNA,都有一个让科研工作者「愤恨不已」的特性——容易降解!麻烦的是,RNA 的质量又与后续实验的结果息息相关,这使得 RNA 就如同一个磨人的小妖精般,给科研工作者增加了各种烦恼,浪费时间和人力物力,因此,在与 RNA 相关的研究中,RNA 的质控就显得尤其重要了。

以总 RNA 为例,在全自动类分析仪器还没有面世之前,科研工作者要么采用定量的方式大致测试浓度来判定总 RNA 的质量,或是采用相对麻烦的琼脂糖凝胶电泳来检验总 RNA 的完整性。在全自动类分析仪器相继面世后,早前的方法的各种弊端就出现了。

使用琼脂糖凝胶电泳法检验总 RNA 完整性的方法有着各式各样的缺陷,一是本身操作比较复杂,二则是凭借肉眼观察总 RNA 质量是否合格这种方式本身即存在着人为误差。当肉眼观察到总 RNA 存在部分降解时,根本无法准确判定总 RNA 是否还能应用于下一步实验。



Fig.1  Total RNA tested by Agarose Gel Electrophoresis


这种情况下,全自动核酸蛋白分析系统 Qsep100 就能完美解决您的疑问,您只需要将样本放入仪器选择相应的程序,即可对 RNA 样本进行自动上样分析,并且 Qsep100 特有的分析软件 Q-Analyzer 能够自动抓取识别 18S、28S 两条带,并且自动得出 28S 和 18S 的比值以及得到 RNA 的质量指数(RNA quality number 即 RQN 值),在 RQN 值大于 7 时,即表明 RNA 的质量不错。




Fig.2  Total RNA tested by Qsep100


此外,大部分实验人员可能会有这种经历,明明定量的时候总 RNA 的质量达到了 100+ng/μL,看似提取效果很好应该没有降解,但是后续的实验总是失败;而有时候定量的总 RNA 浓度明明很低,只有 10+ng/μL,看似几乎没有提取成功或是降解严重,但是后续的实验却能完成的很好,这种情况总能让实验人员抓狂不已,直叹 RNA 怎么这么磨人……因此可以看出,单纯定量的方式得到总 RNA 浓度对后续实验来说还远远不够,实验人员还需要进行 RNA 质控才行。而 Qsep100 全自动核酸蛋白分析系统就能完全满足实验人员对 RNA 质控的需要。



Fig.3  Total RNA tested by Qsep100(Nanodrop: 102.5ng/μL)


Fig.4  Total RNA tested by Qsep100(Nanodrop: 18.6 ng/μL)


除了对总 RNA 进行质控外,Qsep100 全自动核酸蛋白分析系统还能对 mRNA、miRNA 等类型样本进行分析检测。其操作简单,通量灵活可 1-96 任意样本数上样,整个过程无需制胶、染色、加样、拍照等步骤,也不需荧光标记,只需将待检测样本放于仪器样品盘,选择程序即可全自动上样电泳出结果,无污染无伤害。

将 Qsep100 全自动核酸蛋白分析系统应用于 RNA 的质控,将帮助科研工作者更加简单方便地了解样本质量以及是否进行下一步实验,为科研工作者节省了大量人力物力和时间。当然,Qsep100 也能对各种类型的 DNA 样本进行分析测试,且分辨率高,灵敏度极佳,是实验室中不可或缺的好帮手。

有了 Qsep100 全自动核酸蛋白分析系统,实验中 RNA 这位小妖精也就不再「磨人」啦!


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