国内首套完整的单细胞分离和鉴定系统在清华投入使用

国内首套完整的基于微流控技术的单细胞分离和鉴定系统在清华大学投入使用

2014年2月，由美国FLUDIGM公司生产的C₁^TM单细胞全自动制备系统和BioMark^TM HD基因分析系统正式在清华大学基因组与合成生物学平台启用。

C₁^TM 单细胞全自动制备系统基于Fluidigm创新的微流体技术，能够让研究者们快速可靠地分离单个细胞并进行基因组分析。前所未有地将分离细胞、提取、逆转录和预放大全过程实现全面自动化，使细胞活性的检测和分析成为可能。BioMark HD基因分析系统则整合先进的微流控芯片和qPCR技术，为客户提供芯片的高通量和qPCR的准确性。随着C₁^TM和BioMark^TM HD 系统的广泛应用，Fluidigm正在成为单细胞基因组学这一新兴领域的佼佼者。它可以让研究者们轻松检测到单细胞水平上的基因组特征。

C₁^TM单细胞全自动制备系统

 
BioMark^TM HD基因分析系统

2013年斯坦福大学的Stephen R Quake研究组在《自然·方法学》上发表了利用C1微流控分离系统的研究论文，对肺癌细胞系HCT116的96个细胞进行了转录组的分析，并对比了6个单管操作的结果，在对比了主要的单细胞转录组扩增试剂SMARTer Ultra Low RNA Kit (Clontech)和theTransPlex Kit (Sigma-Aldrich)之后，发现C1系统在转录组水平上，有更好的重复性和数据的稳定性。并证明了C1，已经可以承担大量单细胞分离和cDNA扩增的工作，为后面的转录组研究提供了很好的平台。随后，来自EMBL的John C Marioni和Marcus G Heisler研究组在《自然·方法学》又做了拟南芥和小鼠的单细胞表达谱，也对C1进行来自植物和来自小鼠组织的单细胞转录组研究能力给予了很高的评价。而来自瑞典卡罗林斯卡学院的StenLinnarsson研究组在《自然·方法学》上发表了关于分子标记和随机扩增的方法结合C1，可以更大程度上保证扩增的线性，从而还原转录组最初的状态的文章。

本网站记者就此采访了清华大学基因组与合成生物学平台负责人田埂博士，田埂博士说：“单细胞的研究是生命科学领域发展最快的研究方向之一，而稳定的单细胞分离和核酸扩增技术是这一领域最核心的支撑技术，C1的出现改变了以前靠手工挑选单细胞，用单管扩增带来的各种问题，使得高通量的单细胞研究成为可能，让科学家的想象力可以不受到技术的局限，将在很大程度上推进肿瘤、免疫和发育生物学的研究在真正的单细胞水平取得大的进展…”

这两套单细胞制备及分析利器落户清华大学，将进一步加强清华大学生命科学研究的科研能力，我们相信在不久的将来看到清华大学在单细胞研究领域取得重要突破。