多层组学整合分析 | 毒液蛋白质组学与毒腺转录组学对墨西哥响尾蛇联合分析

毒液蛋白质组学与毒腺转录组学对墨西哥响尾蛇联合分析

基本信息

材料：蛇毒液，毒腺

主要技术：NGS、LCMS蛋白质组

期刊： J. Proteome Res

影响因子：4.2453

文章摘要

成年响尾蛇表达两种类型的蛇毒：出血性蛇毒，神经性蛇毒。哥斯达黎加响尾蛇能够由内在miRNA调控自身蛇毒类型，出血性蛇毒和神经性蛇毒相互转变。研究显示，C. simus和C. tzabcan会表达一种出血性蛇毒和神经性蛇毒的过度物质。C. culminatus只表达典型的出血性蛇毒。研究结果指出miRNA在蛇毒组成变动起着关键作用：在蛇体内存在双向功能的miRNA，既能抑制PLA2毒素的转录同时又能上调靶向SVMP（蛇毒金属蛋白酶）的mRNA表达，最终会造成蛇毒成分的类型变动。

方法流程

小鹿推荐

 有关miRNA在蛇毒生物学中起着核心作用的假说，到目前为止有效的研究证明极为有   限，随着组学研究技术的发展，这一假说有新的途径予以证明。本文就属于利用最新   技术对原有假说予以证明的典型案例。文章结合蛋白质组和转录组分别对毒液和毒腺   检测和分析。转录组为因，蛋白质组为果，因果相辅相成，相互验证，使毒液类型转   化的分子机理推断更严谨更可信。

小鹿指南

 在目前各种类型的组学中，核酸组学(主要是基因组学和转录组学)告诉我们可能发生   什么（发掘生命现象的底层原因），蛋白组学告诉我们将要发生什么（发掘生命现象   的表层原因），而代谢组学告诉我们正在发生什么（发掘生命现象的分子结果）。将   不同组学结果进行深入整合，实现从原因和结果两个层面探究生命现象的分子本质，   这将使得我们的研究更全面、更可靠。

 舒烈波博士 

 鹿明总经理 

 于2011年发布国内第一篇多层组学文章

文献来源

Jordi. et al., Integrated venomics and venom gland transcriptome analysis of juvenile and adult Mexican rattlesnakes Crotalus simus, C. tzabcan and C. culminatus revealed miRNA-modulated ontogenetic shifts. 2017, J. Proteome Res.